RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492354.1

SZRD1-210, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-210ENST00000492354 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.66□□□□□ -1.34
SZRD1-210ENST00000492354 IGLV1-51P01701 117 aa6.66□□□□□ -1.34
SZRD1-210ENST00000492354 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SZRD1-210ENST00000492354 FHL2Q14192 279 aa6.66□□□□□ -1.34
SZRD1-210ENST00000492354 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.66□□□□□ -1.34
SZRD1-210ENST00000492354 PF4P02776 101 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-210ENST00000492354 GYPEP15421 78 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-210ENST00000492354 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-210ENST00000492354 NOTCH1P46531 2555 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-210ENST00000492354 CCDC179H3BU77 68 aa6.65□□□□□ -1.35
SZRD1-210ENST00000492354 C3orf56Q8N813 242 aa6.65□□□□□ -1.35
SZRD1-210ENST00000492354 DNAL4O96015 105 aa6.64□□□□□ -1.35
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SZRD1-210ENST00000492354 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-210ENST00000492354 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-210ENST00000492354 CCL18P55774 89 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-210ENST00000492354 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.63□□□□□ -1.35
SZRD1-210ENST00000492354 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.63□□□□□ -1.35
SZRD1-210ENST00000492354 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.63□□□□□ -1.35
SZRD1-210ENST00000492354 IGKV2D-28P01615 120 aa6.63□□□□□ -1.35
SZRD1-210ENST00000492354 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.63□□□□□ -1.35
SZRD1-210ENST00000492354 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.63□□□□□ -1.35
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SZRD1-210ENST00000492354 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SZRD1-210ENST00000492354 SVIPQ8NHG7 77 aa6.63□□□□□ -1.35
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SZRD1-210ENST00000492354 MDFIQ99750 246 aa6.62□□□□□ -1.35
SZRD1-210ENST00000492354 TRACP01848 142 aa6.61□□□□□ -1.35
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SZRD1-210ENST00000492354 LECT2O14960 151 aa6.61□□□□□ -1.35
SZRD1-210ENST00000492354 Q8N3U1 123 aa6.61□□□□□ -1.35
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SZRD1-210ENST00000492354 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.6□□□□□ -1.35
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SZRD1-210ENST00000492354 MALP21145 153 aa6.6□□□□□ -1.35
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SZRD1-210ENST00000492354 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.59□□□□□ -1.35
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SZRD1-210ENST00000492354 SS18Q15532 418 aa6.59□□□□□ -1.35
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SZRD1-210ENST00000492354 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.59□□□□□ -1.35
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SZRD1-210ENST00000492354 C22orf24Q9Y442 160 aa6.58□□□□□ -1.36
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SZRD1-210ENST00000492354 X6R8D5 127 aa6.55□□□□□ -1.36
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SZRD1-210ENST00000492354 H0YGX0 51 aa6.54□□□□□ -1.36
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SZRD1-210ENST00000492354 REG3AQ06141 175 aa6.53□□□□□ -1.36
SZRD1-210ENST00000492354 C6orf223Q8N319 242 aa6.52□□□□□ -1.37
SZRD1-210ENST00000492354 A0A1B0GUV1 79 aa6.51□□□□□ -1.37
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SZRD1-210ENST00000492354 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.51□□□□□ -1.37
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SZRD1-210ENST00000492354 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.5□□□□□ -1.37
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SZRD1-210ENST00000492354 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.5□□□□□ -1.37
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SZRD1-210ENST00000492354 C10orf25Q5T742 122 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-210ENST00000492354 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-210ENST00000492354 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-210ENST00000492354 IMUPQ9GZP8 106 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-210ENST00000492354 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-210ENST00000492354 TENM3Q9P273 2699 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-210ENST00000492354 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SZRD1-210ENST00000492354 KIAA0087Q14695 138 aa6.48□□□□□ -1.37
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