RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.55□□□□□ -0.88
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NISCH-212ENST00000488380 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.54□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
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NISCH-212ENST00000488380 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.53□□□□□ -0.88
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NISCH-212ENST00000488380 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.43□□□□□ -0.9
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NISCH-212ENST00000488380 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.36□□□□□ -0.91
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NISCH-212ENST00000488380 LY6G6DO95868 133 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 IGLV1-51P01701 117 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 NOTCH2Q04721 2471 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 M0R2N4 97 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-212ENST00000488380 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
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