RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.82□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 TIMM17BO60830 172 aa9.81□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.81□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.81□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 A0A096LNJ9 63 aa9.8□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.8□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.8□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 Q6ZTC4 211 aa9.8□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.79□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 FSHBP01225 129 aa9.79□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 SLPIP03973 132 aa9.79□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 Q8IZM0 81 aa9.79□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 SNURFQ9Y675 71 aa9.78□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.78□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 CDH23Q9H251 3354 aa9.78□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.78□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 A8MZ25 164 aa9.78□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 A0A0C4DFX4 3053 aa9.78□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 NDUFC1O43677 76 aa9.78□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 SMIM26A0A096LP01 95 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-207ENST00000479054 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-207ENST00000479054 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
NISCH-207ENST00000479054 Q6JHZ5 121 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-207ENST00000479054 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
NISCH-207ENST00000479054 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-207ENST00000479054 FHL3Q13643 280 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-207ENST00000479054 TRIOO75962 3097 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-207ENST00000479054 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-207ENST00000479054 FHL2Q14192 279 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-207ENST00000479054 SCXQ7RTU7 201 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-207ENST00000479054 BEAN1Q3B7T3 259 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-207ENST00000479054 SERP1Q9Y6X1 66 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-207ENST00000479054 BPY2O14599 106 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-207ENST00000479054 A0A096LNI7 61 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-207ENST00000479054 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 KLK9Q2XQG4 91 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 C6orf99Q4VX62 202 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 CYSRT1A8MQ03 144 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.69□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 IGKV2D-28P01615 120 aa9.69□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.69□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.69□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 A0A087WVE0 104 aa9.68□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 A0A1B0GUV1 79 aa9.68□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 Q6ZSN1 163 aa9.68□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 C2orf48Q96LS8 159 aa9.68□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 ZNF292O60281 2723 aa9.68□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 AGRNO00468 2067 aa9.68□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.67□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.67□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.67□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.66□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 AMELXQ99217 191 aa9.66□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.66□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 IGKV4-1P06312 121 aa9.66□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.65□□□□□ -0.86
NISCH-207ENST00000479054 TRAV7A0A075B6U4 112 aa9.65□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 SEC61GP60059 68 aa9.64□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 LINC00315P59091 139 aa9.64□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.64□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 DNAH14Q0VDD8 3507 aa9.64□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 PRO0461Q9UI25 63 aa9.64□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 LINC01546A6NGU7 62 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 H3BNG1 76 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 CFAP54Q96N23 3096 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 MGAQ8IWI9 3026 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 CCKP06307 115 aa9.62□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.62□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 CASC2Q6XLA1 102 aa9.62□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.62□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.62□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 C6orf223Q8N319 242 aa9.62□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 PRO0628Q9UI54 55 aa9.62□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 COX6A2Q02221 97 aa9.61□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.61□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 REG3GQ6UW15 175 aa9.61□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.61□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 C10orf25Q5T742 122 aa9.6□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 MDFIQ99750 246 aa9.6□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 Q6ZQY7 126 aa9.6□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.6□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.59□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 SZT2Q5T011 3432 aa9.59□□□□□ -0.87
NISCH-207ENST00000479054 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.58□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.58□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.57□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 A6NED7 52 aa9.57□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.57□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 CRYGAP11844 174 aa9.56□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 RPS28P62857 69 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
NISCH-207ENST00000479054 PRR4Q16378 134 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93 ms