RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 FHL2Q14192 279 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV2D-28P01615 120 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 C5orf38Q86SI9 138 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 NOTCH1P46531 2555 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 C22orf24Q9Y442 160 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 PFN2P35080 140 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL28P46779 137 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB130BP0DP73 79 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB130AP0DP74 79 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 PPDPFQ9H3Y8 114 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM222AQ5U5X8 452 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ACYP1P07311 99 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CCL18P55774 89 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SMCR5Q8TEV8 140 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM11BQ8TCY0 68 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM110AQ9BQ89 295 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A087WZ39 114 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A087WYN8 130 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 MALP21145 153 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00482Q8N8I6 264 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 PAX4O43316 350 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAL4O96015 105 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 XCL1P47992 114 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 GAGE2AQ6NT46 116 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP5G1P05496 136 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 C6orf226Q5I0X4 101 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 CLPSL2Q6UWE3 100 aa12.99□□□□□ -0.33
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SH3BP1-202ENST00000417536 OR13C6PQ8NH95 151 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A096LPF7 62 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 INAFM2P0DMQ5 153 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00643Q86TS7 51 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ANK2Q01484 3957 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 LECT2O14960 151 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 IMUPQ9GZP8 106 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 H0YGX0 51 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 SS18Q15532 418 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 C14orf132Q9NPU4 83 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 SDIM1Q6ZPB5 146 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 SLPIP03973 132 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00612Q8N6U2 182 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 C3orf56Q8N813 242 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB4AO15263 64 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 SVIPQ8NHG7 77 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 X6R8D5 127 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GUV1 79 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 Q8IZM0 81 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 PRO0255Q9UI72 69 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 PRR3P79522 188 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 NCR3O14931 201 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 CMYA5Q8N3K9 4069 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 TENM3Q9P273 2699 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00269Q8N2A0 174 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 OXLD1Q5BKU9 147 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 Q8N3U1 123 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 MGAM2Q2M2H8 2515 aa12.83□□□□□ -0.35
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB135Q30KP9 77 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CXCL5P42830 114 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 C9orf66Q5T8R8 295 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ORMDL1Q9P0S3 153 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00846Q9NV44 126 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ANGP03950 147 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CFAP161Q6P656 301 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA0087Q14695 138 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM9A6NGZ8 99 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CD164L2Q6UWJ8 174 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 REG3AQ06141 175 aa12.77□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC01561Q8N1V8 128 aa12.77□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM20Q8N5G0 67 aa12.77□□□□□ -0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 LYRM9A8MSI8 78 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 C9orf153Q5TBE3 101 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 C3orf22Q8N5N4 141 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 Q8N814 137 aa12.75□□□□□ -0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM126AQ9H061 195 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 DAD1P61803 113 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 COX17Q14061 63 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 Q8NDZ9 215 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 UQCRQO14949 82 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFC2O95298 119 aa12.73□□□□□ -0.37
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