RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 LECT2O14960 151 aa6.93□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 FSHBP01225 129 aa6.93□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 SLURP1P55000 103 aa6.93□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 TMEM243Q9BU79 118 aa6.93□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 AKAP9Q99996 3911 aa6.93□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 A0A087WZ39 114 aa6.93□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 FHL2Q14192 279 aa6.93□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.93□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 B4DSR2 109 aa6.92□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.92□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 CACNA1HO95180 2353 aa6.91□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 A0A096LNT2 108 aa6.91□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.91□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.91□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 DSCR8Q96T75 97 aa6.91□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 CCL19Q99731 98 aa6.91□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.91□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 J3QLI3 93 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 Q6YL49 198 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZTI0 123 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 UBE2L6O14933 153 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 LINC00158P58513 81 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 Q8N814 137 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 HILS1P60008 231 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 C4orf26Q17RF5 130 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 GHRHP01286 108 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 SLPIP03973 132 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 DSCR9P59020 149 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 DEFB136Q30KP8 78 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.87□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 Q8IZM0 81 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 XCL2Q9UBD3 114 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.86□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 H7BZZ5 65 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 XCL1P47992 114 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 KLKP1Q107X0 134 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZQT0 140 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.85□□□□□ -1.31
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HCG18-242ENST00000602319 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 MRAPQ8TCY5 172 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 C16orf74Q96GX8 76 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 PAX4O43316 350 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 FAM236CP0DP71 79 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 ENHOQ6UWT2 76 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 STHQ8IWL8 128 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-242ENST00000602319 COX17Q14061 63 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 C6orf223Q8N319 242 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.82□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.82□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 PFN2P35080 140 aa6.82□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.82□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.82□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 A0A1B0GUV1 79 aa6.81□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 UBL5Q9BZL1 73 aa6.81□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 KIAA0087Q14695 138 aa6.81□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 LINC00575Q6W349 94 aa6.81□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 TMEM86BQ8N661 226 aa6.81□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.81□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 C16orf95Q9H693 158 aa6.81□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.8□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 CXCL6P80162 114 aa6.8□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 GNLYP22749 145 aa6.8□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.8□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.79□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 C20orf197Q8N268 126 aa6.79□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 H3BQ85 93 aa6.79□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 Q8NDZ9 215 aa6.79□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 CR1P17927 2039 aa6.79□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.79□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 MUC7Q8TAX7 377 aa6.78□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 PLA2G2AP14555 144 aa6.78□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.78□□□□□ -1.32
HCG18-242ENST00000602319 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
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