RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577910.1

RPL17-C18orf32-202, Transcript of RPL17-C18orf32 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene RPL17-C18orf32, Length 1,012 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 GAGE6Q13070 117 aa5.21□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 VSIG2Q96IQ7 327 aa5.21□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 A6NDN8 102 aa5.2□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 TAX1BP3O14907 124 aa5.2□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 CEND1Q8N111 149 aa5.2□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.2□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.2□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 TM2D2Q9BX73 214 aa5.2□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 RETNQ9HD89 108 aa5.2□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa5.19□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.19□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 A0A0J9YY99 117 aa5.19□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 F5H768 121 aa5.19□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 H3BRM9 83 aa5.19□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.19□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 GCSHP23434 173 aa5.19□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 HERVK_113P63121 156 aa5.19□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 COX6A2Q02221 97 aa5.19□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 C12orf74Q32Q52 190 aa5.19□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.19□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.19□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 HIST1H4GQ99525 98 aa5.19□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 COX11Q9Y6N1 276 aa5.19□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.18□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.18□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 SPINK8P0C7L1 97 aa5.18□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 FXYD2P54710 66 aa5.18□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.18□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.18□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa5.18□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 NOTCH1P46531 2555 aa5.17□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.17□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 A0A096LPF7 62 aa5.17□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.17□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.17□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 A0A1B0GUV1 79 aa5.17□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 HTN3P15516 51 aa5.17□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 PTTG1IPP53801 180 aa5.17□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 Q6ZVH6 145 aa5.17□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.17□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.17□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 K7EIL1 84 aa5.16□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 K7EP13 123 aa5.16□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 SMIM13P0DJ93 91 aa5.16□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 RBX1P62877 108 aa5.16□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.16□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 RNF151Q2KHN1 245 aa5.16□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.16□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.16□□□□□ -1.58
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 A0A0J9YXY3 114 aa5.15□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 A0A1B0GWB2 263 aa5.15□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.15□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 TMEM262E9PQX1 116 aa5.15□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 H3BNG1 76 aa5.15□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 NDUFA1O15239 70 aa5.15□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 IGHV3-30P01768 117 aa5.15□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.15□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 LELP1Q5T871 98 aa5.15□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.15□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 A0A0J9YWU9 116 aa5.14□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.14□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 TMEM238C9JI98 176 aa5.14□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 CCL25O15444 150 aa5.14□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 Q6ZTC4 211 aa5.14□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.14□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 TENM3Q9P273 2699 aa5.14□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 MGAM2Q2M2H8 2515 aa5.14□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.13□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.13□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 K7ERJ3 54 aa5.13□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 TIMM17BO60830 172 aa5.13□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 SS18Q15532 418 aa5.13□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 VAMP3Q15836 100 aa5.13□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 RAB37Q96AX2 223 aa5.13□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 LITAFQ99732 161 aa5.13□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.13□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.13□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 SPANXCQ9NY87 97 aa5.13□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.13□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 A0A087WZ39 114 aa5.12□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 H3BUT2 72 aa5.12□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 UBE2V1Q13404 147 aa5.12□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.12□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.12□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.12□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.12□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 A0A1W2PPM0 123 aa5.11□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 IGLL5B9A064 214 aa5.11□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 HERV-K104P63124 156 aa5.11□□□□□ -1.59
RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 MIAQ16674 131 aa5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms