RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 IGIPA6NJ69 53 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 INSP01308 110 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 NREPQ16612 68 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 C14orf177Q52M58 125 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 SPANXN5Q5MJ07 72 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa1.99□□□□□ -2.09
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PTPRM-204ENST00000577468 LINC00846Q9NV44 126 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM14CQ9P0S9 112 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 COL4A1P02462 1669 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 SSC5DA1L4H1 1573 aa1.98□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 MED13Q9UHV7 2174 aa1.98□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa1.98□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV10A0A0B4J240 114 aa1.98□□□□□ -2.09
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PTPRM-204ENST00000577468 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa1.98□□□□□ -2.09
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PTPRM-204ENST00000577468 I3L3M4 83 aa1.98□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 RTL8CO15255 209 aa1.98□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 TLX1NBP0CAT3 122 aa1.98□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 IAPPP10997 89 aa1.98□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 TFF3Q07654 80 aa1.98□□□□□ -2.09
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PTPRM-204ENST00000577468 Q9BRP9 147 aa1.98□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 LENEPQ9Y5L5 61 aa1.98□□□□□ -2.09
PTPRM-204ENST00000577468 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa1.98□□□□□ -2.09
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PTPRM-204ENST00000577468 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa1.97□□□□□ -2.09
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PTPRM-204ENST00000577468 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa1.97□□□□□ -2.09
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PTPRM-204ENST00000577468 IGLV1-47P01700 117 aa1.97□□□□□ -2.09
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PTPRM-204ENST00000577468 C15orf56Q8N910 161 aa1.97□□□□□ -2.09
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PTPRM-204ENST00000577468 DEFB113Q30KQ7 82 aa1.96□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 Q86TA4 180 aa1.96□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa1.96□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM105Q8N8V8 129 aa1.96□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 CNFNQ9BYD5 112 aa1.96□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 ZNRD1Q9P1U0 126 aa1.96□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 PI4KAP42356 2102 aa1.96□□□□□ -2.1
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PTPRM-204ENST00000577468 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa1.95□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 CLPSL1A2RUU4 121 aa1.95□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 M0R3E3 92 aa1.95□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 P0C880 135 aa1.95□□□□□ -2.1
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PTPRM-204ENST00000577468 LINC00483Q53H64 154 aa1.95□□□□□ -2.1
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PTPRM-204ENST00000577468 LYPD1Q8N2G4 141 aa1.95□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa1.95□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00167Q96N53 147 aa1.95□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 DEFB126Q9BYW3 111 aa1.95□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa1.95□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 SDK2Q58EX2 2172 aa1.95□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa1.95□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 FREM3P0C091 2139 aa1.94□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 ESPL1Q14674 2120 aa1.94□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa1.94□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa1.94□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 SHANK1Q9Y566 2161 aa1.94□□□□□ -2.1
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV21A0A0B4J279 112 aa1.94□□□□□ -2.1
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