RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 TMEM126AQ9H061 195 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 ATP5G1P05496 136 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 AKAP9Q99996 3911 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 CR1P17927 2039 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 FBN2P35556 2912 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.1□□□□□ -1.11
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PTPRK-217ENST00000524534 A0A087WYN8 130 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 CCL18P55774 89 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRK-217ENST00000524534 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.09□□□□□ -1.11
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PTPRK-217ENST00000524534 LINC00158P58513 81 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 C3orf56Q8N813 242 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 C16orf74Q96GX8 76 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 CCL24O00175 119 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 UQCRQO14949 82 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 DNAL4O96015 105 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 TMEM86BQ8N661 226 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 A0A087WZ39 114 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
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PTPRK-217ENST00000524534 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 A0A1W2PRX2 142 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.05□□□□□ -1.12
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PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP10-9P60411 292 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 FHL2Q14192 279 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 DEFB113Q30KQ7 82 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 C2orf48Q96LS8 159 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 C2CD3Q4AC94 2353 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRK-217ENST00000524534 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-217ENST00000524534 PLA2G2AP14555 144 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.02□□□□□ -1.13
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PTPRK-217ENST00000524534 Q6JHZ5 121 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 LINC00846Q9NV44 126 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 ACACBO00763 2458 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 OR13C6PQ8NH95 151 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 NCR3O14931 201 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 CRYGAP11844 174 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 SLPIP03973 132 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 SS18Q15532 418 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 PIEZO1Q92508 2521 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 IGLV1-51P01701 117 aa7.99□□□□□ -1.13
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PTPRK-217ENST00000524534 LINC00167Q96N53 147 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 ESM1Q9NQ30 184 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 PTPN13Q12923 2485 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 Q8IZM0 81 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 A0A1B0GUV1 79 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRK-217ENST00000524534 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.96□□□□□ -1.13
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