RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		5.87	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	USP24	Q9UPU5	2620 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	LST1	O00453	97 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	CITED1	Q99966	193 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	TRANK1	O15050	2925 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF843	Q8N446	348 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	SPATA25	Q9BR10	227 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	TIMM17B	O60830	172 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	5.85	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	NREP	Q16612	68 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	COL4A2	P08572	1712 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	CCL18	P55774	89 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193		H7C423	109 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	C6orf99	Q4VX62	202 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	PCSK5	Q92824	1860 aa		5.84	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	INAFM1	C9JVW0	142 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00694	P0DN24	101 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2D3	P61077	147 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2D2	P62837	147 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	LYRM9	A8MSI8	78 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZSN1	163 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	COX7B	P24311	80 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	F8	P00451	2351 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	COX6A2	Q02221	97 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	MGA	Q8IWI9	3026 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	SCX	Q7RTU7	201 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	C20orf197	Q8N268	126 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	AMELX	Q99217	191 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	BRI3	O95415	125 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	UQCRQ	O14949	82 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	UPK3B	Q9BT76	320 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00315	P59091	139 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	ENHO	Q6UWT2	76 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193		J3KT08	172 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC179	H3BU77	68 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZQY7	126 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	PDE6G	P18545	87 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	SMR3A	Q99954	134 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193		H3BQ85	93 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	PLA2G2A	P14555	144 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	MIF	P14174	115 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NEK1-208	ENST00000512193	LY6G6D	O95868	133 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	HILS1	P60008	231 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193		Q9UF83	564 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	BPY2	O14599	106 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM258	P61165	79 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV1-51	P01701	117 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01546	A6NGU7	62 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	USP17L23	D6RBM5	183 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFS5	O43920	106 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	CDH23	Q9H251	3354 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	IMUP	Q9GZP8	106 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193		A0A096LNI7	61 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV2D-28	P01615	120 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193		A0A087WZ39	114 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	SYCN	Q0VAF6	134 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	FHL2	Q14192	279 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193		Q8IZM0	81 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	CCK	P06307	115 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	LELP1	Q5T871	98 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2A	P49459	152 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		5.74	□□□□□ -1.49

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