RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.06	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.06	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	CFC1	P0CG37	223 aa		4.06	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	CRYBA4	P53673	196 aa		4.06	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	HERVK_113	P61574	105 aa		4.06	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	COTL1	Q14019	142 aa		4.06	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.06	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.06	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.05	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.05	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	TSPAN13	O95857	204 aa		4.05	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	APOC4	P55056	127 aa		4.05	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	TIRAP	P58753	221 aa		4.05	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.05	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.05	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.05	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.05	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.05	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.05	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	RETN	Q9HD89	108 aa		4.05	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.05	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.04	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.04	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730		A4D1N5	150 aa		4.04	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730		F5H768	121 aa		4.04	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	APOM	O95445	188 aa		4.04	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	FABP2	P12104	132 aa		4.04	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.04	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	WFDC2	Q14508	124 aa		4.04	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.04	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.04	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.04	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.04	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.03	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.03	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	GAGE6	Q13070	117 aa		4.03	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	DEFB135	Q30KP9	77 aa		4.03	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.03	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.03	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.03	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.03	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.03	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.03	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.03	□□□□□ -1.76
C4BPB-208	ENST00000492730	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730		H3BMG7	143 aa		4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	DEFB4A	O15263	64 aa		4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	RNF183	Q96D59	192 aa		4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	ANK2	Q01484	3957 aa		4.02	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.01	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	TCL1B	O95988	128 aa		4.01	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	NPC2	P61916	151 aa		4.01	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.01	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.01	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.01	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	DAND5	Q8N907	189 aa		4.01	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.01	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.01	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.01	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A0B4J2C4	111 aa		4	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	NDUFA1	O15239	70 aa		4	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A096LPF7	62 aa		3.99	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A0J9YWU9	116 aa		3.99	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	CIDEA	O60543	219 aa		3.99	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	TIMM17B	O60830	172 aa		3.99	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	GYPE	P15421	78 aa		3.99	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	PSMB2	P49721	201 aa		3.99	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	HERVK_113	P63121	156 aa		3.99	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	MIA	Q16674	131 aa		3.99	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730		Q8NAQ8	132 aa		3.99	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	CARD19	Q96LW7	228 aa		3.99	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		3.99	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730		Q9H8V8	135 aa		3.99	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		3.99	□□□□□ -1.77
C4BPB-208	ENST00000492730	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		3.98	□□□□□ -1.77

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