RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 F5H768 121 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 UBE2L6O14933 153 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 LINC01600Q96MT4 127 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 ERG28Q9UKR5 140 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 X6R8D5 127 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 J3QR89 54 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 HERV-K104P63124 156 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 COPS9Q8WXC6 57 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 TCL1BO95988 128 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 CITED1Q99966 193 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 ATRQ13535 2644 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 PSMB2P49721 201 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 DNHD1Q96M86 4753 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 LYRM9A8MSI8 78 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 C3orf56Q8N813 242 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 A8MZ25 164 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 WIPF1O43516 503 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 COL6A5A8TX70 2615 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 ETDBQ3ZM63 59 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 Q9H8V8 135 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 APOC4P55056 127 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1B0GUV1 79 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 PRSS2P07478 247 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 ATXN8Q156A1 80 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 PRO0255Q9UI72 69 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 SFTA2Q6UW10 78 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 TEN1Q86WV5 123 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 SPATA25Q9BR10 227 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 FOXI1Q12951 378 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 GAGE6Q13070 117 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRF-212ENST00000477970 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 TRIAP1O43715 76 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 A0A087WZ39 114 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 DEFB130BP0DP73 79 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 DEFB130AP0DP74 79 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 Q1RN00 199 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 COX7B2Q8TF08 81 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 COX6CP09669 75 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 GYPEP15421 78 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 MTURNQ8N3F0 131 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 MIFP14174 115 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 SLC25A20O43772 301 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 LINC01620Q4KN68 170 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 Q8NAQ8 132 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 STAB1Q9NY15 2570 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 H7C2G1 150 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 SCGB1A1P11684 91 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 CARD19Q96LW7 228 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 LST1O00453 97 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 C9JAW5 83 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 PAX4O43316 350 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 DAND5Q8N907 189 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 H3BT86 120 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 NPC2P61916 151 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRF-212ENST00000477970 SS18Q15532 418 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRF-212ENST00000477970 DEFB135Q30KP9 77 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRF-212ENST00000477970 SIGMAR1Q99720 223 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRF-212ENST00000477970 ATP5G1P05496 136 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRF-212ENST00000477970 DAD1P61803 113 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRF-212ENST00000477970 Q8IZM0 81 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRF-212ENST00000477970 COX7A2LO14548 114 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRF-212ENST00000477970 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRF-212ENST00000477970 CDIP1Q9H305 208 aa8.42□□□□□ -1.06
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