RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 V9GYH0 126 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ADAMTS12P58397 1594 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 CFAP74Q9C0B2 1584 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKARQ7Z5J8 1434 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM14DPA8MWL7 114 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 SPAG11BQ08648 103 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ETDBQ3ZM63 59 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM170BQ5T4T1 132 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 SPAG11AQ6PDA7 123 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCC2Q92887 1545 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 NOTCH1P46531 2555 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 NRXN1Q9ULB1 1477 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 MYO7BQ6PIF6 2116 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCA8O94911 1581 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCC1P33527 1531 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 KCPQ6ZWJ8 1503 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 HMGN4O00479 90 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 PDCD5O14737 125 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ACYP1P07311 99 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 DEFA5Q01523 94 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 NMSQ5H8A3 153 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 AMELXQ99217 191 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 HIGD1BQ9P298 99 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 R4GMQ9 66 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 NCOA2Q15596 1464 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 NAV3Q8IVL0 2385 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGEF5Q12774 1597 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 MYO5CQ9NQX4 1742 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 SCN7AQ01118 1682 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 MRC1P22897 1456 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF815PA8K554 130 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 F2Z2F3 143 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 IGLC2P0DOY2 106 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 IGLC3P0DOY3 106 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 PSMG4Q5JS54 123 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 SFTA2Q6UW10 78 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC01600Q96MT4 127 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 BPESC1Q9GZL8 116 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 RGPD2P0DJD1 1756 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 UGGT2Q9NYU1 1516 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 IQGAP3Q86VI3 1631 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 F8VRH5 84 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CCL18P55774 89 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 WFDC2Q14508 124 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00643Q86TS7 51 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM223AQ8IWN6 122 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 WFDC6Q9BQY6 131 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 SSC5DA1L4H1 1573 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 NUP188Q5SRE5 1749 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 KNDC1Q76NI1 1749 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 HMGXB3Q12766 1538 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 MROH1Q8NDA8 1641 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKRD36A6QL64 1941 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 H3BUT2 72 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CFDP00746 253 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 FBN2P35556 2912 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 HMGN3Q15651 99 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 BAGE3Q86Y29 109 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 IFT172Q9UG01 1749 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 F8WEM9 126 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 M0R135 149 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 UQCR11O14957 56 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CFAP126Q5VTH2 177 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 BAGE2Q86Y30 109 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 C18orf32Q8TCD1 76 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 KDM3BQ7LBC6 1761 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 MYO7AQ13402 2215 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 JMJD1CQ15652 2540 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A1B0GWA3 101 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM223BA6NKX1 122 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 MGPP08493 103 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 Q5BKY6 102 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CUX1P39880 1505 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-205ENST00000462042 DUOX2Q9NRD8 1548 aa1.16□□□□□ -2.22
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