RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411331.1

RNU6-387P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 387, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-387P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-387P-201ENST00000411331 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 MYOM1P52179 1685 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 ZFHX3Q15911 3703 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 BTG2P78543 158 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 PPP3R2Q96LZ3 170 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 SPRR4Q96PI1 79 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 IGLC1P0CG04 106 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 CCDC58Q4VC31 144 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 NF1P21359 2839 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 PKHD1P08F94 4074 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 C10orf113Q5VZT2 155 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 C5orf38Q86SI9 138 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-387P-201ENST00000411331 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 GAPVD1Q14C86 1478 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 TET3O43151 1660 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 K7EP13 123 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 APOC2P02655 101 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 LCN9Q8WX39 176 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 FAM107BQ9H098 131 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 HMGXB3Q12766 1538 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 FAM223AQ8IWN6 122 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 SSSCA1O60232 199 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 DEFB105AQ8NG35 78 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 M0R2T5 61 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 MGPP08493 103 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 FGF7P21781 194 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 SCN7AQ01118 1682 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 TCHHQ07283 1943 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 PCNX1Q96RV3 2341 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 HERC1Q15751 4861 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 SFTA2Q6UW10 78 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 LINC01600Q96MT4 127 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-387P-201ENST00000411331 KIAA0556O60303 1618 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 A2ML1A8K2U0 1454 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 IFNGP01579 166 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 AKAIN1P0CW23 69 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 PP6455Q8WZ26 134 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 FMN2Q9NZ56 1722 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 CUL7Q14999 1698 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 SPINK4O60575 86 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 C9orf153Q5TBE3 101 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 FDCSPQ8NFU4 85 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 S100A12P80511 92 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 TSC22D3Q99576 134 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 FAIMQ9NVQ4 179 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 CRIPTQ9P021 101 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 APLNQ9ULZ1 77 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 ADGRL2O95490 1459 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 LAMA5O15230 3695 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 CREBBPQ92793 2442 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 GNG11P61952 73 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 Q0VG73 95 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 UQCR10Q9UDW1 63 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 NAIPQ13075 1403 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 FAM223BA6NKX1 122 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 HMGN1P05114 100 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 MANBALQ9NQG1 85 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 MXRA5Q9NR99 2828 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-387P-201ENST00000411331 UBE2D3P61077 147 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-387P-201ENST00000411331 UBE2D2P62837 147 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-387P-201ENST00000411331 SCAPERQ9BY12 1400 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-387P-201ENST00000411331 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-387P-201ENST00000411331 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-387P-201ENST00000411331 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-387P-201ENST00000411331 FAT1Q14517 4588 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-387P-201ENST00000411331 NLRP1Q9C000 1473 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-387P-201ENST00000411331 HERC2O95714 4834 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-387P-201ENST00000411331 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-387P-201ENST00000411331 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa-1.12□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms