RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379599.6

NHLRC3-201, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-201ENST00000379599 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.07□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.07□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 PRYO14603 147 aa6.06□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 NPBQ8NG41 125 aa6.06□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 CCDC140Q96MF4 163 aa6.06□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.06□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.05□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.05□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 APOC4P55056 127 aa6.05□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.05□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.05□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.05□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.05□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 ATMQ13315 3056 aa6.05□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.05□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.05□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 Q6ZVQ6 151 aa6.05□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 Q8N6K4 173 aa6.05□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 G3V318 75 aa6.04□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.04□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.04□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.04□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 A8MU10 97 aa6.04□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.04□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 BPY2O14599 106 aa6.04□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 LYNX1P0DP58 116 aa6.04□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 Q6ZRP5 223 aa6.04□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.04□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 AKAP6Q13023 2319 aa6.04□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.04□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.03□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.03□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 GNLYP22749 145 aa6.03□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.03□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 Q6ZTC4 211 aa6.03□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.03□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.03□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 CCL18P55774 89 aa6.03□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF843Q8N446 348 aa6.03□□□□□ -1.44
NHLRC3-201ENST00000379599 E7EQL1 145 aa6.02□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 H3BS24 57 aa6.02□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 M0R2N4 97 aa6.02□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 KLLNB2CW77 178 aa6.02□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.02□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.02□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.02□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 AKAP13Q12802 2813 aa6.02□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 ATP6V0E1O15342 81 aa6.01□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 COX7B2Q8TF08 81 aa6.01□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.01□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.01□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 IGF2RP11717 2491 aa6.01□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.01□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 A8MUN3 132 aa6.01□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 K7EQG2 157 aa6.01□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 Q1T7F1 81 aa6.01□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 Q8N814 137 aa6.01□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.01□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 hDV103S1A0JD37 113 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 M0R378 163 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 ZFHX3Q15911 3703 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF292O60281 2723 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 NCOR2Q9Y618 2525 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 UBE2BP63146 152 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 C2CD3Q4AC94 2353 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 SPINK13Q1W4C9 94 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 Q6ZQT0 140 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 C19orf84I3L1E1 186 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 CXCL6P80162 114 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 ATRXP46100 2492 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 PRR4Q16378 134 aa5.98□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.98□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 DEFB124Q8NES8 71 aa5.98□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.98□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 SYCNQ0VAF6 134 aa5.98□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 MINOS1Q5TGZ0 78 aa5.98□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.98□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 Q6ZSN1 163 aa5.98□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 Q8N9L7 120 aa5.98□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 RELNP78509 3460 aa5.97□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa5.97□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.97□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 IGHV3-11P01762 117 aa5.97□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 Q8N9W7 124 aa5.97□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 ERC2-IT1O76042 136 aa5.96□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 BSPH1Q075Z2 132 aa5.96□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.96□□□□□ -1.45
NHLRC3-201ENST00000379599 COL12A1Q99715 3063 aa5.96□□□□□ -1.46
NHLRC3-201ENST00000379599 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.461e-6■■■□□ 14.9
NHLRC3-201ENST00000379599 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms