RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRTDAPP60985 99 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-655P-201ENST00000362858 UBA52P62987 128 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-655P-201ENST00000362858 PIGYQ3MUY2 71 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-655P-201ENST00000362858 AKAP6Q13023 2319 aa0.03□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa0.03□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 TET3O43151 1660 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 SBF2Q86WG5 1849 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM223BA6NKX1 122 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPRR1AP35321 89 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 DEFB109BQ30KR1 87 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 C12orf57Q99622 126 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 TCEAL7Q9BRU2 100 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 ABCC5O15440 1437 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 ADGRL2O95490 1459 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM218A2RU14 115 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 SEC11AP67812 179 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 DEFB123Q8N688 67 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 LINC01600Q96MT4 127 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAST4O15021 2626 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLCE1Q9P212 2302 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 IGSF10Q6WRI0 2623 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHD9Q3L8U1 2897 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A1B0GWA3 101 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZFHX3Q15911 3703 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 MYO7BQ6PIF6 2116 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 LINC00846Q9NV44 126 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 MRC2Q9UBG0 1479 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 PKDREJQ9NTG1 2253 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 WNK2Q9Y3S1 2297 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 USF3Q68DE3 2245 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 PAPPAQ13219 1627 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 FDCSPQ8NFU4 85 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 LCN9Q8WX39 176 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRO1933Q9H354 126 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 PEG3Q9GZU2 1588 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 GNGT2O14610 69 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 COX6B1P14854 86 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 RBP2P50120 134 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 ABCA2Q9BZC7 2435 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 NDUFC1O43677 76 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 MT-ATP8P03928 68 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPRR1BP22528 89 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 S100A10P60903 97 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 CACFD1Q9UGQ2 172 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF292O60281 2723 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 GAPVD1Q14C86 1478 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-655P-201ENST00000362858 BTAF1O14981 1849 aa-0.03□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 COL4A6Q14031 1691 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 COL7A1Q02388 2944 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A0G2JND7 137 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 C7orf77A4D0Y5 90 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACBD7Q8N6N7 88 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 TOP2BQ02880 1626 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A087WVE0 104 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 H7BZZ5 65 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 K7EQZ3 153 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 MPC2O95563 127 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 LPAP08519 4548 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 HMCN2Q8NDA2 5059 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRM1P04553 51 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRGV9Q99603 122 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 VAMP8Q9BV40 100 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 CACNA1AO00555 2505 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 NCOR1O75376 2440 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 SCN7AQ01118 1682 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 MLH3Q9UHC1 1453 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-655P-201ENST00000362858 ASIPP42127 132 aa-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms