RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266546.10

CLSTN3-201, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN3, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-201ENST00000266546 DSCR8Q96T75 97 aa8.49□□□□□ -1.05
CLSTN3-201ENST00000266546 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.48□□□□□ -1.05
CLSTN3-201ENST00000266546 NDUFA1O15239 70 aa8.48□□□□□ -1.05
CLSTN3-201ENST00000266546 HILS1P60008 231 aa8.48□□□□□ -1.05
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.48□□□□□ -1.05
CLSTN3-201ENST00000266546 NDUFA7O95182 113 aa8.48□□□□□ -1.05
CLSTN3-201ENST00000266546 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CLSTN3-201ENST00000266546 PROK1P58294 105 aa8.48□□□□□ -1.05
CLSTN3-201ENST00000266546 TIMM17BO60830 172 aa8.47□□□□□ -1.05
CLSTN3-201ENST00000266546 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.47□□□□□ -1.05
CLSTN3-201ENST00000266546 FRYQ5TBA9 3013 aa8.47□□□□□ -1.05
CLSTN3-201ENST00000266546 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.47□□□□□ -1.05
CLSTN3-201ENST00000266546 C9orf85Q96MD7 179 aa8.47□□□□□ -1.05
CLSTN3-201ENST00000266546 TIRAPP58753 221 aa8.46□□□□□ -1.05
CLSTN3-201ENST00000266546 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
CLSTN3-201ENST00000266546 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.46□□□□□ -1.05
CLSTN3-201ENST00000266546 Q8N2B8 174 aa8.46□□□□□ -1.05
CLSTN3-201ENST00000266546 hADV29S1A0JD25 119 aa8.46□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.45□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.44□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.44□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.44□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A096LPF7 62 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 C16orf95Q9H693 158 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 M0QXV9 152 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 LINC01006Q8NI28 216 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 COX7CP15954 63 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 DCANP1Q8TF63 244 aa8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 C5orf47Q569G3 176 aa8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.4□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 LINC00694P0DN24 101 aa8.4□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 EDN2P20800 178 aa8.4□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.4□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 C20orf197Q8N268 126 aa8.4□□□□□ -1.06
CLSTN3-201ENST00000266546 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.4□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.4□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 STAB1Q9NY15 2570 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 SLPIP03973 132 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 SERP2Q8N6R1 65 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 C16orf74Q96GX8 76 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 NCR3O14931 201 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 CXCL5P42830 114 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 Q6ZTI0 123 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 ESM1Q9NQ30 184 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 DEFB135Q30KP9 77 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 USP17L23D6RBM5 183 aa8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 PRM2P04554 102 aa8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 DEFB4AO15263 64 aa8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM258P61165 79 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 GYPEP15421 78 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 AMELXQ99217 191 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.36□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.36□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.36□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 UPK3BQ9BT76 320 aa8.36□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 LINC00315P59091 139 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 ENHOQ6UWT2 76 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.34□□□□□ -1.07
CLSTN3-201ENST00000266546 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 CCL18P55774 89 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 NOTCH1P46531 2555 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 MUC3AQ02505 3323 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM236CP0DP71 79 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 FHL3Q13643 280 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 DMDP11532 3685 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 Q6JHZ5 121 aa8.31□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 NDUFC2O95298 119 aa8.31□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 COX6A2Q02221 97 aa8.3□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 PDE6GP18545 87 aa8.3□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.3□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.3□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A087WVE0 104 aa8.3□□□□□ -1.08
CLSTN3-201ENST00000266546 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms