RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 AMELXQ99217 191 aa5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 APOMO95445 188 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV3-30P01768 117 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 P0DMU3 169 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM231AP0DMU4 169 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM231CP0DMU5 169 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0B4J2C4 111 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0J9YXV3 536 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMB2P49721 201 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 TIRAPP58753 221 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 ERG28Q9UKR5 140 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 HERC1Q15751 4861 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0J9YXY3 114 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 H3BMG7 143 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 TIMM17BO60830 172 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPAN13O95857 204 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 IFITM1P13164 125 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 AZU1P20160 251 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2D3P61077 147 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2D2P62837 147 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF183Q96D59 192 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM101Q96IK0 257 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 XCL2Q9UBD3 114 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 NUPR2A6NF83 97 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 K7EQD1 137 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 IGLV1-51P01701 117 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 COX6CP09669 75 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 CFC1BP0CG36 223 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 CFC1P0CG37 223 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 SCGB1A1P11684 91 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 HERVK_113P63121 156 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 WFDC2Q14508 124 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 Q1RN00 199 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 ODF3L2Q3SX64 289 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 C16orf74Q96GX8 76 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 SIGMAR1Q99720 223 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 SPANXDQ9BXN6 97 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 SPANXCQ9NY87 97 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFA12Q9UI09 145 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAH2Q9P225 4427 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 A4D1N5 150 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 H7C423 109 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 M0QXV9 152 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2L6O14933 153 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 ATXN8Q156A1 80 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 ETDBQ3ZM63 59 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 WFDC10AQ9H1F0 79 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAH6Q9C0G6 4158 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 PKD1P98161 4303 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 HSPG2P98160 4391 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV3-33P01772 117 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 PRSS2P07478 247 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 MIAQ16674 131 aa4.98□□□□□ -1.61
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