RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-215ENST00000624145 Q6ZSR3 168 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 NRACQ8N912 160 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 LINC00526Q96FQ7 95 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF407Q9C0G0 2248 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 BEAN1Q3B7T3 259 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 C1orf137Q5JT78 98 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 LIMD2Q9BT23 127 aa3□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 M0QY20 66 aa3□□□□□ -1.93
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ANKRD28-215ENST00000624145 CEP350Q5VT06 3117 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 WNK2Q9Y3S1 2297 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF524Q96C55 264 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 LCTP09848 1927 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 MYLKQ15746 1914 aa2.99□□□□□ -1.93
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ANKRD28-215ENST00000624145 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 MED12Q93074 2177 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 Q8IZM0 81 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF702PQ9H963 129 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 ANK1P16157 1881 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 NOTCH3Q9UM47 2321 aa2.99□□□□□ -1.93
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ANKRD28-215ENST00000624145 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa2.98□□□□□ -1.93
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ANKRD28-215ENST00000624145 TET1Q8NFU7 2136 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 PRLHP81277 87 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 Q6ZSV7 163 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 PROK1P58294 105 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 LINC01556Q5JQF7 62 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 Q9BRP9 147 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 TP73-AS1Q9UF72 201 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 PKDREJQ9NTG1 2253 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 CYSRT1A8MQ03 144 aa2.97□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 A8MZ25 164 aa2.97□□□□□ -1.93
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ANKRD28-215ENST00000624145 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa2.97□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa2.97□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 ACACAQ13085 2346 aa2.97□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa2.97□□□□□ -1.93
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ANKRD28-215ENST00000624145 C2orf48Q96LS8 159 aa2.97□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 WDR81Q562E7 1941 aa2.97□□□□□ -1.93
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ANKRD28-215ENST00000624145 C6orf223Q8N319 242 aa2.97□□□□□ -1.93
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ANKRD28-215ENST00000624145 IGLV2-8P01709 118 aa2.96□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 P0C879 139 aa2.96□□□□□ -1.93
ANKRD28-215ENST00000624145 SBSPONQ8IVN8 264 aa2.96□□□□□ -1.93
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ANKRD28-215ENST00000624145 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa2.96□□□□□ -1.94
ANKRD28-215ENST00000624145 IGLV2-11P01706 119 aa2.96□□□□□ -1.94
ANKRD28-215ENST00000624145 IGKV2-30P06310 120 aa2.96□□□□□ -1.94
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ANKRD28-215ENST00000624145 CENPFP49454 3210 aa2.96□□□□□ -1.94
ANKRD28-215ENST00000624145 MSMPQ1L6U9 139 aa2.96□□□□□ -1.94
ANKRD28-215ENST00000624145 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.96□□□□□ -1.94
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ANKRD28-215ENST00000624145 U3KQK5 164 aa2.96□□□□□ -1.94
ANKRD28-215ENST00000624145 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa2.96□□□□□ -1.94
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ANKRD28-215ENST00000624145 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa2.96□□□□□ -1.94
ANKRD28-215ENST00000624145 A0A087WSZ3 146 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-215ENST00000624145 C1orf134Q5TEV5 83 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-215ENST00000624145 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-215ENST00000624145 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-215ENST00000624145 ZGRF1Q86YA3 2104 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-215ENST00000624145 ROS1P08922 2347 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-215ENST00000624145 TNCP24821 2201 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-215ENST00000624145 Q8N3U1 123 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-215ENST00000624145 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-215ENST00000624145 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
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