RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A087WTM6 91 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 ORMDL2Q53FV1 153 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa22■■□□□ 1.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 EREGO14944 169 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF664Q8N3J9 261 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRCOL1A6NCL2 159 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 PKD1P98161 4303 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPANXA1Q9NS26 97 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYSLTR1Q9Y271 337 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 C2orf66Q6UXQ4 117 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 C18orf32Q8TCD1 76 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC01546A6NGU7 62 aa21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 G0S2P27469 103 aa21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZUT4 128 aa21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 COLCA2A8K830 154 aa21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 BAALCQ8WXS3 180 aa21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCO1O75880 301 aa21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 FA2HQ7L5A8 372 aa21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA12Q7Z6I5 190 aa21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 WFDC2Q14508 124 aa21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 LECT2O14960 151 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q8N814 137 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM104AQ969W3 186 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP10-2P60368 255 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRGC2P03986 189 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 SS18Q15532 418 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAH11Q96DT5 4516 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 AP5S1Q9NUS5 200 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 S100A1P23297 94 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 TOMM6Q96B49 74 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCL25O15444 150 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PKHD1P08F94 4074 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAGE12HA6NDE8 117 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP6V1G1O75348 118 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00614P0C842 121 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC01549A6NIU2 74 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf196B1AJZ1 125 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPSP0C0P6 89 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB5BP61020 215 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDPF1Q6NVV7 123 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM141Q96I45 108 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGIPA6NJ69 53 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 XCL1P47992 114 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP17L23D6RBM5 183 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 C14orf177Q52M58 125 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIMM17AQ99595 171 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZN92 141 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 C16orf90A8MZG2 172 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXI1Q12951 378 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD164L2Q6UWJ8 174 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFITM10A6NMD0 228 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 TEX43Q6ZNM6 134 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERASQ7Z444 233 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCGB3A1Q96QR1 104 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 VCX2Q9H322 139 aa21.71■■□□□ 1.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa21.7■■□□□ 1.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 AMELXQ99217 191 aa21.7■■□□□ 1.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 C2orf88Q9BSF0 95 aa21.7■■□□□ 1.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A096LNJ9 63 aa21.69■■□□□ 1.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 CFAP161Q6P656 301 aa21.69■■□□□ 1.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00173Q6ZV60 143 aa21.68■■□□□ 1.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 HBDP02042 147 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRSS1P07477 247 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 BAGE3Q86Y29 109 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 C15orf56Q8N910 161 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 PMCHL1Q16048 86 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2D1P51668 147 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 COX7A2LO14548 114 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 hDV102S1A0JD36 115 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAH5Q8TE73 4624 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00242Q5T6M2 205 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 GCSHP23434 173 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 BIRC6Q9NR09 4857 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSBP1O75506 76 aa21.59■■□□□ 1.05
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