RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558085.6

TPTEP1-205, Transcript of TPTE pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TPTEP1, Length 1,738 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP1-205ENST00000558085 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
TPTEP1-205ENST00000558085 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa15.03■□□□□ -0
TPTEP1-205ENST00000558085 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa15.02□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa15.01□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 CCL25O15444 150 aa15.01□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 LINC00612Q8N6U2 182 aa15.01□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 APOC4P55056 127 aa15□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 TIRAPP58753 221 aa15□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa15□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 A0A0J9YY99 117 aa15□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 A0A1B0GWB2 263 aa15□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 OR5A1Q8NGJ0 315 aa14.99□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 FBN3Q75N90 2809 aa14.98□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 GAGE12JA6NER3 117 aa14.98□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 GAGE4Q13068 117 aa14.98□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 GAGE5Q13069 117 aa14.98□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 GAGE13Q4V321 117 aa14.98□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa14.98□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 H3BUT2 72 aa14.97□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 UBE2D1P51668 147 aa14.97□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 Q6ZUT4 128 aa14.97□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 SBSPONQ8IVN8 264 aa14.97□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa14.97□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 GAGE10A6NGK3 116 aa14.97□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 FHL2Q14192 279 aa14.97□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 C12orf74Q32Q52 190 aa14.97□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 A0A1W2PPM0 123 aa14.96□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 FABP2P12104 132 aa14.96□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 TSPEAR-AS2P59090 65 aa14.96□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.96□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 RAB37Q96AX2 223 aa14.96□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 TMEM243Q9BU79 118 aa14.96□□□□□ -0.01
TPTEP1-205ENST00000558085 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa14.95□□□□□ -0.02
TPTEP1-205ENST00000558085 LYRM9A8MSI8 78 aa14.95□□□□□ -0.02
TPTEP1-205ENST00000558085 MDFIQ99750 246 aa14.95□□□□□ -0.02
TPTEP1-205ENST00000558085 UBE2L6O14933 153 aa14.95□□□□□ -0.02
TPTEP1-205ENST00000558085 HERVK_113P63121 156 aa14.95□□□□□ -0.02
TPTEP1-205ENST00000558085 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.95□□□□□ -0.02
TPTEP1-205ENST00000558085 TMEM101Q96IK0 257 aa14.95□□□□□ -0.02
TPTEP1-205ENST00000558085 X6R8D5 127 aa14.95□□□□□ -0.02
TPTEP1-205ENST00000558085 VWFP04275 2813 aa14.93□□□□□ -0.02
TPTEP1-205ENST00000558085 K7EP13 123 aa14.93□□□□□ -0.02
TPTEP1-205ENST00000558085 K7EP34 96 aa14.93□□□□□ -0.02
TPTEP1-205ENST00000558085 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa14.93□□□□□ -0.02
TPTEP1-205ENST00000558085 TMEM238C9JI98 176 aa14.92□□□□□ -0.02
TPTEP1-205ENST00000558085 LINC00694P0DN24 101 aa14.92□□□□□ -0.02
TPTEP1-205ENST00000558085 VSIG2Q96IQ7 327 aa14.92□□□□□ -0.02
TPTEP1-205ENST00000558085 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.91□□□□□ -0.02
TPTEP1-205ENST00000558085 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TPTEP1-205ENST00000558085 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa14.9□□□□□ -0.02
TPTEP1-205ENST00000558085 IGLL5B9A064 214 aa14.89□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 IGHV3-30P01768 117 aa14.89□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa14.89□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa14.89□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 SPCS1Q9Y6A9 102 aa14.89□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 K7ERJ3 54 aa14.88□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 DEFB130BP0DP73 79 aa14.87□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 DEFB130AP0DP74 79 aa14.87□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa14.86□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 MIFP14174 115 aa14.86□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 ZFAND6Q6FIF0 208 aa14.86□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 PRO0255Q9UI72 69 aa14.86□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 A0A0J9YXY3 114 aa14.86□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 RPL24P83731 157 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 LINC00242Q5T6M2 205 aa14.86□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 COL6A5A8TX70 2615 aa14.85□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa14.85□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 TIMM17BO60830 172 aa14.85□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 KRTAP10-11P60412 298 aa14.85□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 NDUFA12Q9UI09 145 aa14.85□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa14.84□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa14.84□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.83□□□□□ -0.03
TPTEP1-205ENST00000558085 STAB1Q9NY15 2570 aa14.83□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.83□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 SPINK8P0C7L1 97 aa14.83□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa14.82□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 LYRM7Q5U5X0 104 aa14.82□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.82□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.82□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 SPANXDQ9BXN6 97 aa14.82□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 SPANXCQ9NY87 97 aa14.82□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 DEFB135Q30KP9 77 aa14.81□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa14.81□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 NDUFA1O15239 70 aa14.8□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.8□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.8□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 GYPEP15421 78 aa14.8□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 RNF183Q96D59 192 aa14.8□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa14.79□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa14.79□□□□□ -0.04
TPTEP1-205ENST00000558085 G3V4G9 280 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107 ms