RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 RNF185Q96GF1 192 aa12.89□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF580Q9UK33 172 aa12.88□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa12.88□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 CEP295Q9C0D2 2601 aa12.87□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM223A0PJW6 202 aa12.87□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 BRI3O95415 125 aa12.87□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 C9orf85Q96MD7 179 aa12.87□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 JMJD1CQ15652 2540 aa12.86□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 TAX1BP3O14907 124 aa12.86□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 RBX1P62877 108 aa12.86□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 CLEC2BQ92478 149 aa12.86□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 LELP1Q5T871 98 aa12.85□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 SYCNQ0VAF6 134 aa12.85□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A1W2PPR1 153 aa12.85□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 Q8N976 141 aa12.84□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 WFDC10AQ9H1F0 79 aa12.84□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 PROK1P58294 105 aa12.84□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 PRR9Q5T870 116 aa12.84□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 MP68P56378 58 aa12.83□□□□□ -0.35
PTDSS1-202ENST00000517309 HIGD2AQ9BW72 106 aa12.83□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 HCFC1P51610 2035 aa12.83□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 CD164L2Q6UWJ8 174 aa12.83□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa12.82□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A1B0GX51 115 aa12.82□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 C11orf21Q9P2W6 132 aa12.82□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 WFDC2Q14508 124 aa12.82□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 DSCAML1Q8TD84 2053 aa12.81□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa12.81□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 TSHBP01222 138 aa12.81□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 C16orf95Q9H693 158 aa12.81□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa12.81□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 ABCA12Q86UK0 2595 aa12.8□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 NRACQ8N912 160 aa12.8□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 SMR3AQ99954 134 aa12.8□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 IGLV1-51P01701 117 aa12.8□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa12.8□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 ODF3L2Q3SX64 289 aa12.8□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 CNFNQ9BYD5 112 aa12.79□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00308Q8TCZ7 52 aa12.79□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 OXLD1Q5BKU9 147 aa12.79□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 YPEL4Q96NS1 127 aa12.79□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A087WZ39 114 aa12.78□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 FOXI1Q12951 378 aa12.78□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 ATOX1O00244 68 aa12.78□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa12.78□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 CHD8Q9HCK8 2581 aa12.78□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa12.77□□□□□ -0.36
PTDSS1-202ENST00000517309 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 TIMM17BO60830 172 aa12.76□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 TLN2Q9Y4G6 2542 aa12.76□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 SMIM20Q8N5G0 67 aa12.76□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 UBE2D3P61077 147 aa12.75□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 UBE2D2P62837 147 aa12.75□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 TANC2Q9HCD6 1990 aa12.75□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa12.75□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 XAGE1AQ9HD64 81 aa12.75□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa12.74□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 C7orf33Q8WU49 177 aa12.74□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa12.74□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 TCL1BO95988 128 aa12.73□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 MUC7Q8TAX7 377 aa12.73□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM258P61165 79 aa12.73□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 CLUHP3Q96NS8 147 aa12.73□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa12.73□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa12.72□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 CHCHD7Q9BUK0 85 aa12.72□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa12.72□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa12.72□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 H0Y9J4 135 aa12.72□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A0J9YWU9 116 aa12.71□□□□□ -0.37
PTDSS1-202ENST00000517309 C14orf132Q9NPU4 83 aa12.7□□□□□ -0.38
PTDSS1-202ENST00000517309 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa12.7□□□□□ -0.38
PTDSS1-202ENST00000517309 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00643Q86TS7 51 aa12.69□□□□□ -0.38
PTDSS1-202ENST00000517309 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PTDSS1-202ENST00000517309 BPY2O14599 106 aa12.69□□□□□ -0.38
PTDSS1-202ENST00000517309 TP73-AS1Q9UF72 201 aa12.69□□□□□ -0.38
PTDSS1-202ENST00000517309 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa12.69□□□□□ -0.38
PTDSS1-202ENST00000517309 PRM2P04554 102 aa12.68□□□□□ -0.38
PTDSS1-202ENST00000517309 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa12.68□□□□□ -0.38
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa12.68□□□□□ -0.38
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa12.68□□□□□ -0.38
PTDSS1-202ENST00000517309 UBE2D1P51668 147 aa12.68□□□□□ -0.38
PTDSS1-202ENST00000517309 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa12.68□□□□□ -0.38
PTDSS1-202ENST00000517309 M0R378 163 aa12.68□□□□□ -0.38
PTDSS1-202ENST00000517309 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa12.67□□□□□ -0.38
PTDSS1-202ENST00000517309 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa12.67□□□□□ -0.38
PTDSS1-202ENST00000517309 COX17Q14061 63 aa12.67□□□□□ -0.38
PTDSS1-202ENST00000517309 C6orf99Q4VX62 202 aa12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.7 ms