RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516171.1

RNU6-436P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 436, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-436P, Length 114 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-436P-201ENST00000516171 ZZEF1O43149 2961 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 CCL8P80075 99 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 LAMA1P25391 3075 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 ZFHX3Q15911 3703 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 RYR1P21817 5038 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 KIAA0556O60303 1618 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 PITX3O75364 302 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 E2F6O75461 281 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 V9GYH0 126 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 ADGRB1O14514 1584 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 AKAP13Q12802 2813 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 PATJQ8NI35 1801 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 DEFB112Q30KQ8 113 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 SEC11CQ9BY50 192 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 TMEM2Q9UHN6 1383 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 BIRC6Q9NR09 4857 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 SNCGO76070 127 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 SPTSSAQ969W0 71 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 SPRR2FQ96RM1 72 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 AMELXQ99217 191 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 SMPXQ9UHP9 88 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-436P-201ENST00000516171 Q6ZUT4 128 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 MMGT1Q8N4V1 131 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 CDC26Q8NHZ8 85 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 AQP10Q96PS8 301 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 LENEPQ9Y5L5 61 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 FMN2Q9NZ56 1722 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 NCR2O95944 276 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 APOC3P02656 99 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 COX8AP10176 69 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 CCDC153Q494R4 210 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 Q6AWC8 147 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 LYSTQ99698 3801 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 BTAF1O14981 1849 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 REV3LO60673 3130 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 TSTD3H0UI37 97 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 UQCR11O14957 56 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 NDUFB6O95139 128 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 SIX6O95475 246 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 IFNGP01579 166 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 C10orf128Q5T292 105 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 BAGE2Q86Y30 109 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 CENPHQ9H3R5 247 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 HMGXB3Q12766 1538 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 IFT140Q96RY7 1462 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 TRANK1O15050 2925 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 APLNQ9ULZ1 77 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 HSPB11Q9Y547 144 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 V9GYQ6 96 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 HCG22E2RYF7 251 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 F8VRH5 84 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 TPPP2P59282 170 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 TTC9CQ8N5M4 171 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 GINS2Q9Y248 185 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 TEX15Q9BXT5 2789 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 OVOS2Q6IE36 1432 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 DMXL1Q9Y485 3027 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 DBIP07108 87 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 MORN2Q502X0 79 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 TAC4Q86UU9 113 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 DDA1Q9BW61 102 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 SPANXCQ9NY87 97 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 ACACAQ13085 2346 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 KALRNO60229 2985 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU6-436P-201ENST00000516171 IGLC6P0CF74 106 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-436P-201ENST00000516171 ALX1Q15699 326 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-436P-201ENST00000516171 SCIMPQ6UWF3 145 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-436P-201ENST00000516171 USMG5Q96IX5 58 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-436P-201ENST00000516171 NAA60Q9H7X0 242 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-436P-201ENST00000516171 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-1.66□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.6 ms