RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471308.5

PCBP4-208, Transcript of poly(rC) binding protein 4, human

TSL 2

Gene PCBP4, Length 2,087 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP4-208	ENST00000471308	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	PRO0461	Q9UI25	63 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	CUBN	O60494	3623 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308		A4D1N5	150 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	WFDC2	Q14508	124 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308		J3QR89	54 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	SIGMAR1	Q99720	223 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	SPATA25	Q9BR10	227 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	SPANXC	Q9NY87	97 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	SPINK8	P0C7L1	97 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	HERVK_113	P63121	156 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	LITAF	Q99732	161 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PCBP4-208	ENST00000471308	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	PSMB2	P49721	201 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	GAGE12J	A6NER3	117 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	TIMM17B	O60830	172 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	GAGE4	Q13068	117 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	GAGE5	Q13069	117 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	ETDB	Q3ZM63	59 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	ACAN	P16112	2415 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	IGHV3-33	P01772	117 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	ITPR2	Q14571	2701 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	GAGE7	O76087	117 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	GAGE12F	P0CL80	117 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	GAGE12G	P0CL81	117 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	GAGE12I	P0CL82	117 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	MIA	Q16674	131 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	SFTA2	Q6UW10	78 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	ERG28	Q9UKR5	140 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	NDUFA1	O15239	70 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	PF4	P02776	101 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	LINC00694	P0DN24	101 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308		H7C423	109 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	MTURN	Q8N3F0	131 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	TCL1B	O95988	128 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	RNF183	Q96D59	192 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	TMEM101	Q96IK0	257 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	TMEM243	Q9BU79	118 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	UBE2L6	O14933	153 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308		A0A1B0GV72	72 aa		12.02	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		12.02	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		12.02	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	MTOR	P42345	2549 aa		12.02	□□□□□ -0.48
PCBP4-208	ENST00000471308	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308		A8MZ25	164 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	PRSS2	P07478	247 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	IFITM1	P13164	125 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	COX6A2	Q02221	97 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	SMR3A	Q99954	134 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	KRTAP10-3	P60369	221 aa		12	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308		Q1RN00	199 aa		12	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	LY6G6D	O95868	133 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	HIVEP2	P31629	2446 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	INSL3	P51460	131 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	FHL2	Q14192	279 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	JMJD1C	Q15652	2540 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	11.97	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308		H7C2G1	150 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PCBP4-208	ENST00000471308	COPS9	Q8WXC6	57 aa		11.97	□□□□□ -0.49

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