RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa11.45□□□□□ -0.58
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SHQ1-202ENST00000444040 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
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SHQ1-202ENST00000444040 K7EQD1 137 aa11.45□□□□□ -0.58
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SHQ1-202ENST00000444040 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa11.42□□□□□ -0.58
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SHQ1-202ENST00000444040 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa11.4□□□□□ -0.59
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SHQ1-202ENST00000444040 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.4□□□□□ -0.59
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SHQ1-202ENST00000444040 GAGE12IP0CL82 117 aa11.36□□□□□ -0.59
SHQ1-202ENST00000444040 SMIM1B2RUZ4 78 aa11.36□□□□□ -0.59
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SHQ1-202ENST00000444040 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa11.35□□□□□ -0.59
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SHQ1-202ENST00000444040 SLC25A20O43772 301 aa11.35□□□□□ -0.59
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SHQ1-202ENST00000444040 C9JAW5 83 aa11.35□□□□□ -0.59
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SHQ1-202ENST00000444040 DAND5Q8N907 189 aa11.34□□□□□ -0.59
SHQ1-202ENST00000444040 Q9H8V8 135 aa11.34□□□□□ -0.59
SHQ1-202ENST00000444040 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.34□□□□□ -0.59
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SHQ1-202ENST00000444040 F5H768 121 aa11.33□□□□□ -0.6
SHQ1-202ENST00000444040 CIDEAO60543 219 aa11.33□□□□□ -0.6
SHQ1-202ENST00000444040 ICOSQ9Y6W8 199 aa11.33□□□□□ -0.6
SHQ1-202ENST00000444040 LINC01620Q4KN68 170 aa11.32□□□□□ -0.6
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM243Q9BU79 118 aa11.32□□□□□ -0.6
SHQ1-202ENST00000444040 JMJD1CQ15652 2540 aa11.32□□□□□ -0.6
SHQ1-202ENST00000444040 SCGB1A1P11684 91 aa11.32□□□□□ -0.6
SHQ1-202ENST00000444040 LINC01600Q96MT4 127 aa11.31□□□□□ -0.6
SHQ1-202ENST00000444040 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SHQ1-202ENST00000444040 MTORP42345 2549 aa11.31□□□□□ -0.6
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