RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376362.1

GKAP1-201, Transcript of G kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GKAP1, Length 1,237 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1-201ENST00000376362 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa0.48□□□□□ -2.33
GKAP1-201ENST00000376362 COX6CP09669 75 aa0.48□□□□□ -2.33
GKAP1-201ENST00000376362 CNFNQ9BYD5 112 aa0.48□□□□□ -2.33
GKAP1-201ENST00000376362 FAIMQ9NVQ4 179 aa0.48□□□□□ -2.33
GKAP1-201ENST00000376362 LINC00474Q9P2X8 69 aa0.48□□□□□ -2.33
GKAP1-201ENST00000376362 SHROOM2Q13796 1616 aa0.48□□□□□ -2.33
GKAP1-201ENST00000376362 SHANK2Q9UPX8 1470 aa0.48□□□□□ -2.33
GKAP1-201ENST00000376362 SFT2D2O95562 160 aa0.47□□□□□ -2.33
GKAP1-201ENST00000376362 MGPP08493 103 aa0.47□□□□□ -2.33
GKAP1-201ENST00000376362 FAM213BQ8TBF2 198 aa0.47□□□□□ -2.33
GKAP1-201ENST00000376362 SPCS1Q9Y6A9 102 aa0.47□□□□□ -2.33
GKAP1-201ENST00000376362 ARHGAP5Q13017 1502 aa0.47□□□□□ -2.33
GKAP1-201ENST00000376362 WNK3Q9BYP7 1800 aa0.47□□□□□ -2.33
GKAP1-201ENST00000376362 KDM3BQ7LBC6 1761 aa0.47□□□□□ -2.33
GKAP1-201ENST00000376362 MYOM1P52179 1685 aa0.46□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa0.46□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 PSME4Q14997 1843 aa0.46□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 TMEM218A2RU14 115 aa0.46□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 HAMPP81172 84 aa0.46□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 C12orf57Q99622 126 aa0.46□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 MANBALQ9NQG1 85 aa0.46□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa0.46□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 PRO1854Q9UHT4 67 aa0.46□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa0.46□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 SBF2Q86WG5 1849 aa0.45□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 TNCP24821 2201 aa0.45□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 Q0VG73 95 aa0.45□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 C14orf144Q96I85 54 aa0.45□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa0.44□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa0.44□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 TRAV22A0A0B4J277 110 aa0.44□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 SPINK1P00995 79 aa0.44□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 TRAPPC2P0DI81 140 aa0.44□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 TRAPPC2BP0DI82 140 aa0.44□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 SNCAP37840 140 aa0.44□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 RBP2P50120 134 aa0.44□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 UBE2D3P61077 147 aa0.44□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 UBE2D2P62837 147 aa0.44□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 Q5BKY6 102 aa0.44□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 Q6JHZ5 121 aa0.44□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa0.43□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa0.43□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 ACBD7Q8N6N7 88 aa0.43□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 LINC00472Q9H8W2 130 aa0.43□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 PRO0255Q9UI72 69 aa0.43□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 AP4S1Q9Y587 144 aa0.43□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa0.43□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 ERCC6L2Q5T890 1561 aa0.43□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa0.43□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 BDP1A6H8Y1 2624 aa0.43□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 TET3O43151 1660 aa0.43□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 PLXNB2O15031 1838 aa0.43□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 MDN1Q9NU22 5596 aa0.42□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 CACNA1EQ15878 2313 aa0.42□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa0.42□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 NDUFC1O43677 76 aa0.42□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 IGLC1P0CG04 106 aa0.42□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 ZNF236Q9UL36 1845 aa0.42□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 CACNA1HO95180 2353 aa0.42□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa0.42□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 TTC28Q96AY4 2481 aa0.42□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 LRP6O75581 1613 aa0.42□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
GKAP1-201ENST00000376362 HMGXB3Q12766 1538 aa0.4□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 A0A1B0GWA3 101 aa0.4□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 UBA52P62987 128 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 SEC11AP67812 179 aa0.4□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 FAM223AQ8IWN6 122 aa0.4□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 SPRR4Q96PI1 79 aa0.4□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 MRC2Q9UBG0 1479 aa0.4□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa0.39□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 ABCA12Q86UK0 2595 aa0.39□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 MUC5ACP98088 5654 aa0.39□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 BCE1O60756 84 aa0.39□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 LINC00032P0C843 101 aa0.39□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 S100A10P60903 97 aa0.39□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 PIGYQ3MUY2 71 aa0.39□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 Q8IZM0 81 aa0.39□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 PRO1933Q9H354 126 aa0.39□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa0.39□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 ARHGEF5Q12774 1597 aa0.39□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa0.39□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 CELSR2Q9HCU4 2923 aa0.39□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 CNTLNQ9NXG0 1405 aa0.38□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa0.38□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 hADV29S1A0JD25 119 aa0.38□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 GNGT2O14610 69 aa0.38□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 VAMP8Q9BV40 100 aa0.38□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 USP24Q9UPU5 2620 aa0.38□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 FAM208BQ5VWN6 2430 aa0.38□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 ABCA3Q99758 1704 aa0.38□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 TOP2BQ02880 1626 aa0.38□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 ABCC5O15440 1437 aa0.38□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 TPRP12270 2363 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 NSD3Q9BZ95 1437 aa0.38□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 GAPVD1Q14C86 1478 aa0.37□□□□□ -2.35
GKAP1-201ENST00000376362 FYCO1Q9BQS8 1478 aa0.37□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 164.7 ms