RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 H7C2G1 150 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 SOCS3O14543 225 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 TENM1Q9UKZ4 2725 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 KLLNB2CW77 178 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 FHL2Q14192 279 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01620Q4KN68 170 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 CARD19Q96LW7 228 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 V9GYV3 84 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 USP17L23D6RBM5 183 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 LEPROTL1O95214 131 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 ZFP2Q6ZN57 461 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 NUP35Q8NFH5 326 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 MLST8Q9BVC4 326 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 TSTD3H0UI37 97 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 CXCL1P09341 107 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 PRR9Q5T870 116 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 FAM231DQ6ZW35 169 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 A6NDN8 102 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A20O43772 301 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 NMUP48645 174 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 FOXI1Q12951 378 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01559Q495D7 138 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 STPG4Q8N801 248 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 CRIP1P50238 77 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 COX6A2Q02221 97 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 PMVKQ15126 192 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 MPV17L2Q567V2 206 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM126AQ9H061 195 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 APLNQ9ULZ1 77 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 COLCA2A8K830 154 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 TRGC2P03986 189 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 NPC2P61916 151 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZSN1 163 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 C19orf71A6NCJ1 209 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 PHOX2AO14813 284 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 RPL24P83731 157 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 VAMP3Q15836 100 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 FAM104BQ5XKR9 115 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 TNP2Q05952 138 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 CT83Q5H943 113 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF575Q86XF7 245 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 A0A096LNI7 61 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 A6NJY4 79 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 F8WEM9 126 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 RTL8CO15255 209 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 PSMB2P49721 201 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM2Q9BVW6 85 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 TAL2Q16559 108 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01549A6NIU2 74 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 NIT1Q86X76 327 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM141Q96I45 108 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 C14orf144Q96I85 54 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 COPS9Q8WXC6 57 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 FAM231BA6NCW3 169 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 HBDP02042 147 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 BATFQ16520 125 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF664Q8N3J9 261 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00467Q9BRT7 94 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf21Q9P2W6 132 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 HERVK_113P63121 156 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 PMCHL2Q9BQD1 86 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 CHAC1Q9BUX1 264 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 TIMM21Q9BVV7 248 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 K7EP13 123 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 DDTP30046 118 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 BOD1L2Q8IYS8 172 aa3.09□□□□□ -1.92
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