RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF185Q96GF1 192 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP4-201ENST00000344528 U3KQK5 164 aa12.09□□□□□ -0.47
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SH3BP4-201ENST00000344528 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
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SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP4-201ENST00000344528 C4orf48Q5BLP8 95 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0B4J2C4 111 aa12.08□□□□□ -0.48
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SH3BP4-201ENST00000344528 HCFC1P51610 2035 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP4-201ENST00000344528 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa12.06□□□□□ -0.48
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SH3BP4-201ENST00000344528 SPTBN4Q9H254 2564 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP4-201ENST00000344528 PRR9Q5T870 116 aa12.05□□□□□ -0.48
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SH3BP4-201ENST00000344528 WFDC10AQ9H1F0 79 aa12.05□□□□□ -0.48
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SH3BP4-201ENST00000344528 C11orf21Q9P2W6 132 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP4-201ENST00000344528 C9orf85Q96MD7 179 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP4-201ENST00000344528 RBX1P62877 108 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP4-201ENST00000344528 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP4-201ENST00000344528 TANC2Q9HCD6 1990 aa12.02□□□□□ -0.49
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SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF580Q9UK33 172 aa12.01□□□□□ -0.49
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SH3BP4-201ENST00000344528 NRACQ8N912 160 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-201ENST00000344528 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-201ENST00000344528 HIGD2AQ9BW72 106 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-201ENST00000344528 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP4-201ENST00000344528 BRI3O95415 125 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP4-201ENST00000344528 SYCNQ0VAF6 134 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP4-201ENST00000344528 LELP1Q5T871 98 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP4-201ENST00000344528 TSHBP01222 138 aa12□□□□□ -0.49
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SH3BP4-201ENST00000344528 YPEL4Q96NS1 127 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP4-201ENST00000344528 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
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SH3BP4-201ENST00000344528 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.99□□□□□ -0.49
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SH3BP4-201ENST00000344528 IGLV1-51P01701 117 aa11.96□□□□□ -0.5
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SH3BP4-201ENST00000344528 C16orf95Q9H693 158 aa11.93□□□□□ -0.5
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SH3BP4-201ENST00000344528 PTH2Q96A98 100 aa11.91□□□□□ -0.5
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SH3BP4-201ENST00000344528 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa11.9□□□□□ -0.5
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SH3BP4-201ENST00000344528 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC00643Q86TS7 51 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa11.88□□□□□ -0.51
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SH3BP4-201ENST00000344528 TP73-AS1Q9UF72 201 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 C6orf99Q4VX62 202 aa11.87□□□□□ -0.51
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SH3BP4-201ENST00000344528 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa11.87□□□□□ -0.51
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