RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.55	□□□□□ -1.84	not detected
TOP1	YOL006C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YIG1	Q08956	461 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YPL260W	Q08977	551 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YPL277C	Q08989	487 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	NMD4	Q12129	218 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	HER1	Q12276	1246 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	NSI1	Q12457	570 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	CBS1	P14066	229 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	PUT4	P15380	627 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	PRE8	P23639	250 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	NFS1	P25374	497 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	MRP4	P32902	394 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	MRPL40	P36534	297 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YBL028C	P38202	106 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	SMF1	P38925	575 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	MRX1	P40050	688 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YER158C	P40095	573 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YJL181W	P46987	611 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	GYP7	P48365	746 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YLR302C	O13544	120 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	CWH43	P25618	953 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	SLA2	P33338	968 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	HEL1	P36113	551 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YBL029W	P38201	376 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	MSC7	P38694	644 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	MUP3	P38734	546 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YDR089W	P38966	869 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	TCB2	P48231	1178 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	MMR1	Q06324	491 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	MDM36	Q06820	579 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	FMP45	Q07651	309 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	ENT4	Q07872	247 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	RSB1	Q08417	382 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	ACM1	Q08981	209 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	COX17	Q12287	69 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YOR019W	Q99248	730 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	STE12	P13574	688 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YCK1	P23291	538 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YCR051W	P25631	222 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	PHO91	P27514	894 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	MRP20	P32387	263 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YEL057C	P39983	233 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	MET18	P40469	1032 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	ULI1	P43604	169 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	NUP85	P46673	744 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YKE2	P52553	114 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	IMA1	P53051	589 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	MNT2	P53059	558 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	ORC4	P54791	529 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	CPR2	P23285	205 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	SRP101	P32916	621 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	SAP190	P36123	1033 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YHR054C	P38780	354 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	BEM4	P39011	633 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	PKP1	P40530	394 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YBP2	P53169	641 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YNR071C	P53757	342 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	ARP4	P80428	489 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	MEC3	Q02574	474 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	RAD30	Q04049	632 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	TRI1	Q05024	226 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YLR407W	Q06070	228 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	RRT8	Q08219	342 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	RIM20	Q12033	661 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	DIN7	Q12086	430 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YLR149C	Q99296	730 aa		3.53	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.2 ms