RNA–Protein interactions for RNA: YGR163W

GTR2, Transcript of Putative GTP binding protein, yeast

Gene GTR2, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GTR2	YGR163W	MRPL9	P31334	269 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	RPC34	P32910	317 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	NIC96	P34077	839 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	GRX7	P38068	203 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	SDH8	P38345	138 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	YLF2	P38746	405 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	ASK10	P48361	1146 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	PEX8	P53248	589 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	YNL034W	P53963	612 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	THI7	Q05998	598 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	HOT13	P36078	116 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	TAX4	P47030	604 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	SEG1	Q04279	960 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	IRC3	Q06683	689 aa		4.11	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	CTT1	P06115	562 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	CDC5	P32562	705 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	YPT10	P38146	199 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	APD1	P38281	316 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	VFA1	P40080	203 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	IDS2	P46958	469 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	WAR1	Q03631	944 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	ORM2	Q06144	216 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.1	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	STB5	P38699	743 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	LNP1	P38878	278 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	SWD1	P39706	426 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	YFL015C	P43578	164 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	YJL043W	P47053	257 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	COS12	P53053	380 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	TGL2	P54857	326 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	TRS31	Q03337	283 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	RIM13	Q03792	727 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	ENT2	Q05785	613 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	CRD1	Q07560	283 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	ARP7	Q12406	477 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	MPD2	Q99316	277 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTR2	YGR163W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	YKL133C	P36066	463 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	RAD26	P40352	1085 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	LAS21	P40367	830 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	PIP2	P52960	996 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	ADH4	P10127	382 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	MAM1	P40065	302 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	LTP1	P40347	161 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	IMA5	P40884	581 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	TDA10	P42938	290 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	YJR008W	P47085	338 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	VPS64	Q03944	604 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	AAD4	Q07747	329 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
GTR2	YGR163W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	NUP1	P20676	1076 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	EXO1	P39875	702 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	POL31	P46957	487 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	COG2	P53271	262 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	MLC2	Q06580	163 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	PCL8	Q08966	492 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	ATP4	P05626	244 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	APN1	P22936	367 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	YCR061W	P25639	631 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	GSY2	P27472	705 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	MTG2	P38860	518 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	ATP23	P53722	227 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	YNL058C	P53947	316 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	AAT1	Q01802	451 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	MET14	Q02196	202 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	BI2	P03873	423 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	MDM10	P18409	493 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	MBR1	P23493	339 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	GDA1	P32621	518 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	YNL092W	P53934	400 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	ACS1	Q01574	713 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	CRF1	Q04930	467 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	BSP1	Q06604	576 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	PTP1	P25044	335 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	PTP2	P29461	750 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	SWC3	P31376	625 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	CIR1	P42940	261 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	MAD3	P47074	515 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	TEP1	P53916	434 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	RAD33	Q04231	177 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
GTR2	YGR163W	NYV1	Q12255	253 aa		4.03	□□□□□ -1.76

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