RNA–Protein interactions for RNA: YDR297W

SUR2, Transcript of Sphinganine C4-hydroxylase, yeast

Gene SUR2, Length 1,050 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SUR2	YDR297W	YKU70	P32807	602 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	BUD2	P33314	1104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	SDS22	P36047	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YKR018C	P36114	725 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YRO2	P38079	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RFC5	P38251	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	EXO5	P38289	585 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MED8	P38304	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	TDA3	P38758	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	ERC1	P38767	581 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RTS1	P38903	757 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	TMN3	P40071	706 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	INA22	P40576	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	GSM1	P42950	618 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	VPS53	P47061	822 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	EAF6	P47128	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	TFC6	Q06339	672 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	LOT6	Q07923	191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	GUP2	Q08929	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	APL4	Q12028	832 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	REX3	Q12090	404 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RAD3	P06839	778 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	CBP3	P21560	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	VPS3	P23643	1011 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	DPH2	P32461	534 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	SRB4	P32569	687 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YEL043W	P32618	956 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	AFR1	P33304	620 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MDJ1	P35191	511 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MYO3	P36006	1272 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RSM22	P36056	628 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	KTR4	P38131	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	BCD1	P38772	366 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	AKR1	P39010	764 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	ECM1	P39715	212 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MPH1	P40562	993 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	PHB1	P40961	287 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	QRI7	P43122	407 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	SFB2	P53953	876 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	HOT1	Q03213	719 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	NHX1	Q04121	633 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YKU80	Q04437	629 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	ATG33	Q06485	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RSC3	Q06639	885 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	GLO4	Q12320	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	SFI1	Q12369	946 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RAD61	Q99359	647 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	GSC2	P40989	1895 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MSS18	P08593	268 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	PRP28	P23394	588 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MBR1	P23493	339 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RIT1	P23796	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RAD16	P31244	790 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MEI5	P32489	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	EMC3	P36039	253 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MAL33	P38157	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	HSL7	P38274	827 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	FTH1	P38310	465 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	SAW1	P39735	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	FET4	P40988	552 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	SPO74	P45819	413 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	SAP4	P53036	818 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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