RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 KRT86O43790 486 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ATP2B4P23634 1241 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 GTF3C6Q969F1 213 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 FAM107BQ9H098 131 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 GOPCQ9HD26 462 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 RASAL2Q9UJF2 1139 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CTAGE9A4FU28 777 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 UBXN1Q04323 297 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 PPARAQ07869 468 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 TUBB2AQ13885 445 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 AKNAD1Q5T1N1 836 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 TUBB2BQ9BVA1 445 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CTAGE15A4D2H0 777 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CTAGE8P0CG41 777 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 LIG1P18858 919 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 NLRP12P59046 1061 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CTAGE6Q86UF2 777 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CTAGE4Q8IX94 777 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ZMYM6O95789 1325 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 TTC38Q5R3I4 469 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 KCNH3Q9ULD8 1083 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ADCY9O60503 1353 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 KCNQ3O43525 872 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CTNNA2P26232 953 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ADCY7P51828 1080 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 TMC4Q7Z404 712 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 HOOK3Q86VS8 718 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 MLKLQ8NB16 471 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 IQCDQ96DY2 449 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CALUO43852 315 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 TAF5LO75529 589 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 TUBBP07437 444 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 RXRAP19793 462 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 VWA3BQ502W6 1294 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 IMPG2Q9BZV3 1241 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 VWA3AA6NCI4 1184 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 PFKFB2O60825 505 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 GALNT17Q6IS24 598 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 DYDC1Q8WWB3 177 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 AGLP35573 1532 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 HSF2BPO75031 334 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 DDAH1O94760 285 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CPA1P15085 419 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF174Q15697 407 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 IQGAP1P46940 1657 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ERBB3P21860 1342 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 BRD1O95696 1058 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 RPS8P62241 208 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 KIF5AQ12840 1032 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 UBE3CQ15386 1083 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 NUP58Q9BVL2 599 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CTR9Q6PD62 1173 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 IFNKQ9P0W0 207 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 NEURL4Q96JN8 1562 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 USP31Q70CQ4 1352 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 EPB41P11171 864 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 GOLGA1Q92805 767 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 TMOD4Q9NZQ9 345 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1B0GVL5 298 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 NT5C2P49902 561 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 LETM2Q2VYF4 491 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 MSANTD4Q8NCY6 345 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 PICK1Q9NRD5 415 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ITSN1Q15811 1721 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 PHACTR2O75167 634 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA0753Q2KHM9 967 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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