RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253339.9

LATS1-201, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LATS1, Length 4,256 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-201ENST00000253339 MCL1Q07820 350 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 GGT6Q6P531 493 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 NT5C1AQ9BXI3 368 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 SUV39H2Q9H5I1 410 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 ZMYM5Q9UJ78 669 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 KIF3AQ9Y496 699 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 IGHA2P01877 340 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 TP53P04637 393 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 MAN1A1P33908 653 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 SOX9P48436 509 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 SCNN1BP51168 640 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 KCTD2Q14681 263 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 GPR153Q6NV75 609 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 RELTQ969Z4 430 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 MKS1Q9NXB0 559 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 TMEM63CQ9P1W3 806 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 AGR2O95994 175 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 JMJD7P0C870 316 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 HALP42357 657 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 SLC9A5Q14940 896 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 CCDC157Q569K6 752 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 KRT26Q7Z3Y9 468 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 SAMM50Q9Y512 469 aa4.35□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 EML1O00423 815 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 HIF1AQ16665 826 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 CFAP100Q494V2 611 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 ATP6V1E2Q96A05 226 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 RUNDC1Q96C34 613 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 MRFAP1Q9Y605 127 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 GNRH1P01148 92 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 ARSDP51689 593 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 NUCB1Q02818 461 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 LONRF1Q17RB8 773 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 SRLQ86TD4 932 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 PHC3Q8NDX5 983 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 USP33Q8TEY7 942 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 MYO19Q96H55 970 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 SPATA9Q9BWV2 254 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 CARD11Q9BXL7 1154 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 LIN7BQ9HAP6 207 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 PRDM11Q9NQV5 511 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa4.34□□□□□ -1.71
LATS1-201ENST00000253339 RGS3P49796 1198 aa4.34□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 LMNB2Q03252 620 aa4.34□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 VPS72Q15906 364 aa4.34□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 TMEM67Q5HYA8 995 aa4.34□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 FAM209AQ5JX71 171 aa4.34□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 TTC6Q86TZ1 520 aa4.34□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 SYNPOQ8N3V7 929 aa4.34□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 COPB2P35606 906 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 KCNJ6P48051 423 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 STRA8Q7Z7C7 330 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 TRIM22Q8IYM9 498 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 CNTD1Q8N815 330 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 SLC26A8Q96RN1 970 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 CLIP1P30622 1438 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 METTL12A8MUP2 240 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 F2P00734 622 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 TPM3P06753 285 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 POLD1P28340 1107 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 C1orf53Q5VUE5 145 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 DMRTA1Q5VZB9 504 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 CCDC116Q8IYX3 515 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 IFNL3Q8IZI9 196 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 PLD4Q96BZ4 506 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 SENP7Q9BQF6 1050 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 RUSC1Q9BVN2 902 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 APOL5Q9BWW9 433 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 SCINQ9Y6U3 715 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 ABCC9O60706 1549 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 ARHGAP33O14559 1287 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 STAT4Q14765 748 aa4.33□□□□□ -1.72
LATS1-201ENST00000253339 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms