RNA–Protein interactions for RNA: YMR135W-A

YMR135W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YMR135W-A, Length 534 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR135W-AYMR135W-A ATF2P53296 535 aa7.58□□□□□ -1.2
YMR135W-AYMR135W-A SSA4P22202 642 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
YMR135W-AYMR135W-A RCR1P38212 213 aa7.57□□□□□ -1.2
YMR135W-AYMR135W-A BRL1P38770 471 aa7.57□□□□□ -1.2
YMR135W-AYMR135W-A REF2P42073 533 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
YMR135W-AYMR135W-A PKC1P24583 1151 aa7.56□□□□□ -1.2
YMR135W-AYMR135W-A BIM1P40013 344 aa7.55□□□□□ -1.2
YMR135W-AYMR135W-A GLN1P32288 370 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
YMR135W-AYMR135W-A YTA7P40340 1379 aa7.54□□□□□ -1.2
YMR135W-AYMR135W-A RRN6P32786 894 aa7.53□□□□□ -1.2
YMR135W-AYMR135W-A TIF4632P39936 914 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
YMR135W-AYMR135W-A HEM3P28789 327 aa7.52□□□□□ -1.21
YMR135W-AYMR135W-A BRN1P38170 754 aa7.52□□□□□ -1.21
YMR135W-AYMR135W-A YRB30P53107 440 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
YMR135W-AYMR135W-A MRM1P25270 412 aa7.5□□□□□ -1.21
YMR135W-AYMR135W-A CDC3P32457 520 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
YMR135W-AYMR135W-A ATG32P40458 529 aa7.5□□□□□ -1.21
YMR135W-AYMR135W-A SSF1P38789 453 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
YMR135W-AYMR135W-A YJL007CP47080 104 aa7.49□□□□□ -1.21
YMR135W-AYMR135W-A DOS2P54858 310 aa7.49□□□□□ -1.21
YMR135W-AYMR135W-A SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
YMR135W-AYMR135W-A TGL3P40308 642 aa7.48□□□□□ -1.21
YMR135W-AYMR135W-A NOP53Q12080 455 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
YMR135W-AYMR135W-A SSA2P10592 639 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
YMR135W-AYMR135W-A COQ8P27697 501 aa7.47□□□□□ -1.21
YMR135W-AYMR135W-A RTG3P38165 486 aa7.47□□□□□ -1.21
YMR135W-AYMR135W-A COX6P00427 148 aa7.46□□□□□ -1.22
YMR135W-AYMR135W-A FAR11P53917 953 aa7.46□□□□□ -1.22
YMR135W-AYMR135W-A RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
YMR135W-AYMR135W-A OCA5P38738 679 aa7.45□□□□□ -1.22
YMR135W-AYMR135W-A CPS1P27614 576 aa7.44□□□□□ -1.22
YMR135W-AYMR135W-A SPC42P36094 363 aa7.44□□□□□ -1.22
YMR135W-AYMR135W-A RPL34BP40525 121 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
YMR135W-AYMR135W-A TTI1P36097 1038 aa7.42□□□□□ -1.22
YMR135W-AYMR135W-A NOB1Q08444 459 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
YMR135W-AYMR135W-A TIF1P10081 395 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
YMR135W-AYMR135W-A CSN12P47130 423 aa7.41□□□□□ -1.22
YMR135W-AYMR135W-A ERG12P07277 443 aa7.4□□□□□ -1.22
YMR135W-AYMR135W-A ATG36P46983 293 aa7.4□□□□□ -1.22
YMR135W-AYMR135W-A NUG1P40010 520 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
YMR135W-AYMR135W-A ITT1Q04638 464 aa7.37□□□□□ -1.23
YMR135W-AYMR135W-A LAM6Q08001 693 aa7.37□□□□□ -1.23
YMR135W-AYMR135W-A HAT1Q12341 374 aa7.37□□□□□ -1.23
YMR135W-AYMR135W-A NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data7.36□□□□□ -1.23not detected
YMR135W-AYMR135W-A FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
YMR135W-AYMR135W-A YPR204WQ08995 1032 aa7.36□□□□□ -1.23
YMR135W-AYMR135W-A ASF1P32447 279 aa7.35□□□□□ -1.23
YMR135W-AYMR135W-A RTS3P53289 263 aa7.35□□□□□ -1.23
YMR135W-AYMR135W-A SWE1P32944 819 aa7.34□□□□□ -1.23
YMR135W-AYMR135W-A UBP14P38237 781 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
YMR135W-AYMR135W-A YAF9P53930 226 aa7.34□□□□□ -1.23
YMR135W-AYMR135W-A VPS29P38759 282 aa7.33□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A EDS1P38073 919 aa7.32□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A RTG2P32608 588 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A YBL036CP38197 257 aa7.31□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A NMD2P38798 1089 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A YAP5P40574 245 aa7.31□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A ALD4P46367 519 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A NNF1P47149 201 aa7.31□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A SUB1P54000 292 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A YML083CQ04526 418 aa7.31□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A KTR1P27810 393 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A BIO2P32451 375 aa7.3□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A STM1P39015 273 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A PUP1P25043 261 aa7.29□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A MIF2P35201 549 aa7.29□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A IPL1P38991 367 aa7.29□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data7.29□□□□□ -1.24not detected
YMR135W-AYMR135W-A KEX1P09620 729 aa7.28□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A YJR008WP47085 338 aa7.28□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A ALD2P47771 506 aa7.28□□□□□ -1.24
YMR135W-AYMR135W-A SEC20P28791 383 aa7.27□□□□□ -1.25
YMR135W-AYMR135W-A PSE1P32337 1089 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
YMR135W-AYMR135W-A YDR090CQ03193 310 aa7.27□□□□□ -1.25
YMR135W-AYMR135W-A YOR238WQ08634 303 aa7.27□□□□□ -1.25
YMR135W-AYMR135W-A VPS72Q03388 795 aa7.26□□□□□ -1.25
YMR135W-AYMR135W-A CST6P40535 587 aa7.25□□□□□ -1.25
YMR135W-AYMR135W-A RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
YMR135W-AYMR135W-A MST1P07236 462 aa7.24□□□□□ -1.25
YMR135W-AYMR135W-A SVF1Q05515 481 aa7.24□□□□□ -1.25
YMR135W-AYMR135W-A DBP1P24784 617 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
YMR135W-AYMR135W-A YNL108CP53929 270 aa7.23□□□□□ -1.25
YMR135W-AYMR135W-A SIS2P36024 562 aa7.22□□□□□ -1.25
YMR135W-AYMR135W-A STS1P38637 319 aa7.22□□□□□ -1.25
YMR135W-AYMR135W-A OSW7P43611 510 aa7.22□□□□□ -1.25
YMR135W-AYMR135W-A TYW1Q08960 810 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YMR135W-AYMR135W-A CSE4P36012 229 aa7.21□□□□□ -1.26
YMR135W-AYMR135W-A VHR2P40041 505 aa7.21□□□□□ -1.26
YMR135W-AYMR135W-A MSC6Q08818 692 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YMR135W-AYMR135W-A SUP45P12385 437 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
YMR135W-AYMR135W-A YFR006WP43590 535 aa7.2□□□□□ -1.26
YMR135W-AYMR135W-A UBX5Q06682 500 aa7.2□□□□□ -1.26
YMR135W-AYMR135W-A YBL113CQ7M4S9 792 aa7.2□□□□□ -1.26
YMR135W-AYMR135W-A PTC3P34221 468 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
YMR135W-AYMR135W-A RNH70P53331 553 aa7.19□□□□□ -1.26
YMR135W-AYMR135W-A PIB1Q06651 286 aa7.19□□□□□ -1.26
YMR135W-AYMR135W-A ENO1P00924 437 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
YMR135W-AYMR135W-A TEA1P47988 759 aa7.18□□□□□ -1.26
YMR135W-AYMR135W-A ATE1P16639 503 aa7.17□□□□□ -1.26
YMR135W-AYMR135W-A TGL4P36165 910 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.1 ms