RNA–Protein interactions for RNA: YKR057W

RPS21A, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS21A, Length 264 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS21A	YKR057W	YBT1	P32386	1661 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS21A	YKR057W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RPS21A	YKR057W	SPT7	P35177	1332 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPS21A	YKR057W	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
RPS21A	YKR057W	VPS15	P22219	1454 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPS21A	YKR057W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
RPS21A	YKR057W	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
RPS21A	YKR057W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPS21A	YKR057W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPS21A	YKR057W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
RPS21A	YKR057W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
RPS21A	YKR057W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPS21A	YKR057W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPS21A	YKR057W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPS21A	YKR057W	IFH1	P39520	1085 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RPS21A	YKR057W	SNT2	P53127	1403 aa		4.46	□□□□□ -1.69
RPS21A	YKR057W	RTT106	P40161	455 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RPS21A	YKR057W	DNF1	P32660	1571 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RPS21A	YKR057W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
RPS21A	YKR057W	VTH1	P40438	1549 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RPS21A	YKR057W	VTH2	P40890	1549 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RPS21A	YKR057W	NUP159	P40477	1460 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RPS21A	YKR057W	IRC20	Q06554	1556 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RPS21A	YKR057W	GCN2	P15442	1659 aa		4.43	□□□□□ -1.7
RPS21A	YKR057W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
RPS21A	YKR057W	SRB8	P25648	1427 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPS21A	YKR057W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
RPS21A	YKR057W	YFR006W	P43590	535 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS21A	YKR057W	CAT8	P39113	1433 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPS21A	YKR057W	CDC25	P04821	1589 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPS21A	YKR057W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RPS21A	YKR057W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS21A	YKR057W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPS21A	YKR057W	TFA1	P36100	482 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS21A	YKR057W	MHP1	P43638	1398 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS21A	YKR057W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPS21A	YKR057W	NTE1	Q04958	1679 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS21A	YKR057W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPS21A	YKR057W	PDR12	Q02785	1511 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS21A	YKR057W	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RPS21A	YKR057W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RPS21A	YKR057W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
RPS21A	YKR057W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.32	□□□□□ -1.72
RPS21A	YKR057W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	4.32	□□□□□ -1.72
RPS21A	YKR057W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.31	□□□□□ -1.72
RPS21A	YKR057W	LEU3	P08638	886 aa		4.31	□□□□□ -1.72
RPS21A	YKR057W	YPR148C	Q06523	435 aa		4.31	□□□□□ -1.72
RPS21A	YKR057W	SPO14	P36126	1683 aa		4.31	□□□□□ -1.72
RPS21A	YKR057W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.31	□□□□□ -1.72
RPS21A	YKR057W	BUD3	P25558	1636 aa		4.29	□□□□□ -1.72
RPS21A	YKR057W	IME2	P32581	645 aa		4.29	□□□□□ -1.72
RPS21A	YKR057W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
RPS21A	YKR057W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
RPS21A	YKR057W	CAB3	P36076	571 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RPS21A	YKR057W	OPY1	P38271	328 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RPS21A	YKR057W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RPS21A	YKR057W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	YCK3	P39962	524 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	NST1	P53935	1240 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	LTE1	P07866	1435 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	DOP1	Q03921	1698 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	CKB1	P43639	278 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	MET5	P47169	1442 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	RPC31	P17890	251 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	CLC1	P17891	233 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	DNF2	Q12675	1612 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	RAV1	P47104	1357 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	NUP192	P47054	1683 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	PDR11	P40550	1411 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.21	□□□□□ -1.73
RPS21A	YKR057W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	PAF1	P38351	445 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	VMR1	P38735	1592 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	MET10	P39692	1035 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	YIR014W	P40570	242 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	CDC45	Q08032	650 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	IOC4	Q04213	475 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	ITT1	Q04638	464 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	SNF2	P22082	1703 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	BNI1	P41832	1953 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	DRS2	P39524	1355 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	TAF5	P38129	798 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	IML1	P47170	1584 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS21A	YKR057W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 108.6 ms