RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 FKBP8Q14318 412 aa4.07□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa4.07□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 CREBRFQ8IUR6 639 aa4.07□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 AK7Q96M32 723 aa4.07□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa4.06□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP4.06□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM193AP78312 1265 aa4.06□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 CHMP3Q9Y3E7 222 aa4.05□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 TEX35Q5T0J7 233 aa4.05□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 FYB1O15117 783 aa4.05□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC175P0C221 793 aa4.04□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 DDRGK1Q96HY6 314 aa4.04□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 CDR1P51861 262 aa4.04□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 BECN1Q14457 450 aa4.04□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 PCGF6Q9BYE7 350 aa4.04□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP4.03□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 TSPYL1Q9H0U9 437 aa4.03□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 MNS1Q8NEH6 495 aa4.03□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 PPP4R2Q9NY27 417 aa4.03□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 MBD3O95983 291 aa4.03□□□□□ -1.76
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC191Q8NCU4 936 aa4.02□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 CLSTN1O94985 981 aa4.02□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 TPM4P67936 248 aa4.02□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 CEP89Q96ST8 783 aa4.02□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 ZBTB7CA1YPR0 619 aa4.02□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 MYH16Q9H6N6 1097 aa4.02□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 GPS2Q13227 327 aa4.02□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 MAP7D2Q96T17 732 aa4.02□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 TPM3P06753 285 aa4.01□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 TRIM63Q969Q1 353 aa4.01□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 UBTFP17480 764 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 CASC1Q6TDU7 716 aa4.01□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 INCENPQ9NQS7 918 aa4.01□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 C14orf37Q86TY3 774 aa4□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 DCTN1Q14203 1278 aa4□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 E9PSI1 815 aa4□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 CHMP4AQ9BY43 222 aa4□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa4□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa4□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC70Q6NSX1 233 aa3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 MSNP26038 577 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC34Q96HJ3 373 aa3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 SETSIPP0DME0 302 aa3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC112Q8NEF3 446 aa3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 CAGE1Q8TC20 777 aa3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 CFAP57Q96MR6 1250 aa3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 FEZ1Q99689 392 aa3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 NBR1Q14596 966 aa3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 DYDC1Q8WWB3 177 aa3.99□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 HDAC5Q9UQL6 1122 aa3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 TPM1P09493 284 aa3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 TRIM52Q96A61 297 aa3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 SEPT10Q9P0V9 454 aa3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 USP8P40818 1118 aa3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 SPATA24Q86W54 205 aa3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 TCHPQ9BT92 498 aa3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP3.98□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 CCP110O43303 1012 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 GOLGA2Q08379 1002 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 RDXP35241 583 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 TPM2P07951 284 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 CSRNP3Q8WYN3 585 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 NF2P35240 595 aa3.97□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 CFAP44Q96MT7 982 aa3.96□□□□□ -1.77
JMJD1C-210ENST00000542921 GBP4Q96PP9 640 aa3.96□□□□□ -1.78
JMJD1C-210ENST00000542921 TRIM41Q8WV44 630 aa3.96□□□□□ -1.78
JMJD1C-210ENST00000542921 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
JMJD1C-210ENST00000542921 TAX1BP1Q86VP1 789 aa3.96□□□□□ -1.78
JMJD1C-210ENST00000542921 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
JMJD1C-210ENST00000542921 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC27Q2M243 656 aa3.95□□□□□ -1.78
JMJD1C-210ENST00000542921 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa3.95□□□□□ -1.78
JMJD1C-210ENST00000542921 PAF1Q8N7H5 531 aa3.95□□□□□ -1.78
JMJD1C-210ENST00000542921 ACBD3Q9H3P7 528 aa3.95□□□□□ -1.78
JMJD1C-210ENST00000542921 TMCO5BA8MYB1 307 aa3.95□□□□□ -1.78
JMJD1C-210ENST00000542921 HOMEZQ8IX15 550 aa3.95□□□□□ -1.78
JMJD1C-210ENST00000542921 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
JMJD1C-210ENST00000542921 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
JMJD1C-210ENST00000542921 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP3.94□□□□□ -1.78
JMJD1C-210ENST00000542921 DEF6Q9H4E7 631 aa3.94□□□□□ -1.78
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM114A2Q9NRY5 505 aa3.94□□□□□ -1.78
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