RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410499.1

RNU6-141P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 141, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-141P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-141P-201ENST00000410499 SLC4A2P04920 1241 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-141P-201ENST00000410499 EMP3P54852 163 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-141P-201ENST00000410499 PHF12Q96QT6 1004 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-141P-201ENST00000410499 FAM205CA6NFA0 338 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-141P-201ENST00000410499 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-141P-201ENST00000410499 PRR29P0C7W0 189 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-141P-201ENST00000410499 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-141P-201ENST00000410499 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-141P-201ENST00000410499 SPDYE2BA6NHP3 402 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-141P-201ENST00000410499 SNPHO15079 494 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-141P-201ENST00000410499 SPDYE6P0CI01 402 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-141P-201ENST00000410499 SPDYE2Q495Y8 402 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-141P-201ENST00000410499 Q6ZNB5 142 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-141P-201ENST00000410499 MS4A3Q96HJ5 214 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-141P-201ENST00000410499 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-141P-201ENST00000410499 LCE2BO14633 110 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-141P-201ENST00000410499 RGS20O76081 388 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-141P-201ENST00000410499 NPM3O75607 178 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-141P-201ENST00000410499 SEC24BO95487 1268 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-141P-201ENST00000410499 PTGER2P43116 358 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-141P-201ENST00000410499 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-141P-201ENST00000410499 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-141P-201ENST00000410499 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-141P-201ENST00000410499 SSUH2Q9Y2M2 353 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-141P-201ENST00000410499 TRAF7Q6Q0C0 670 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-141P-201ENST00000410499 HCSTQ9UBK5 93 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-141P-201ENST00000410499 TRPC6Q9Y210 931 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF787Q6DD87 383 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-141P-201ENST00000410499 XP32Q5T750 250 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-141P-201ENST00000410499 IER5LQ5T953 404 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-141P-201ENST00000410499 STK17AQ9UEE5 414 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-141P-201ENST00000410499 LCE3BQ5TA77 95 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-141P-201ENST00000410499 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-141P-201ENST00000410499 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-141P-201ENST00000410499 ERBB3P21860 1342 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-141P-201ENST00000410499 TIE1P35590 1138 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-141P-201ENST00000410499 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-141P-201ENST00000410499 A0A0G2JS52 829 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-141P-201ENST00000410499 TTLL13PA6NNM8 815 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-141P-201ENST00000410499 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-141P-201ENST00000410499 CREBZFQ9NS37 354 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-141P-201ENST00000410499 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-141P-201ENST00000410499 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF687Q8N1G0 1237 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-141P-201ENST00000410499 TRIM35Q9UPQ4 493 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-141P-201ENST00000410499 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-141P-201ENST00000410499 LAPTM4AQ15012 233 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-141P-201ENST00000410499 IFFO2Q5TF58 517 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-141P-201ENST00000410499 PLCG2P16885 1265 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-141P-201ENST00000410499 TREML4Q6UXN2 200 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-141P-201ENST00000410499 BTBD11A6QL63 1104 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-141P-201ENST00000410499 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RNU6-141P-201ENST00000410499 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RNU6-141P-201ENST00000410499 KIF12Q96FN5 646 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-141P-201ENST00000410499 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RNU6-141P-201ENST00000410499 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP4.4□□□□□ -1.71
RNU6-141P-201ENST00000410499 GFRA3O60609 400 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-141P-201ENST00000410499 FBLN2P98095 1184 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-141P-201ENST00000410499 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RNU6-141P-201ENST00000410499 CCDC61Q9Y6R9 512 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-141P-201ENST00000410499 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-141P-201ENST00000410499 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP4.31□□□□□ -1.72
RNU6-141P-201ENST00000410499 MAP3K13O43283 966 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-141P-201ENST00000410499 C3orf67Q6ZVT6 689 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF710Q8N1W2 664 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-141P-201ENST00000410499 WIPF1O43516 503 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-141P-201ENST00000410499 LCE1DQ5T752 114 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-141P-201ENST00000410499 OCEL1Q9H607 264 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-141P-201ENST00000410499 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RNU6-141P-201ENST00000410499 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 POTECB2RU33 542 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RNU6-141P-201ENST00000410499 WFS1O76024 890 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-141P-201ENST00000410499 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
RNU6-141P-201ENST00000410499 DOK7Q18PE1 504 aa4.18□□□□□ -1.74
RNU6-141P-201ENST00000410499 POTEEQ6S8J3 1075 aa4.18□□□□□ -1.74
RNU6-141P-201ENST00000410499 KCTD17Q8N5Z5 321 aa4.17□□□□□ -1.74
RNU6-141P-201ENST00000410499 FAM181BA6NEQ2 426 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-141P-201ENST00000410499 PTPN5P54829 565 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-141P-201ENST00000410499 TMEM106CQ9BVX2 250 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-141P-201ENST00000410499 ADGRD1Q6QNK2 874 aa4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 174.1 ms