RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-202ENST00000392011 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNH8Q96L42 1107 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-202ENST00000392011 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP4-202ENST00000392011 NACADO15069 1562 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF27Q86VH2 1401 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-202ENST00000392011 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.3
SH3BP4-202ENST00000392011 RGL3Q3MIN7 710 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-202ENST00000392011 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-202ENST00000392011 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-202ENST00000392011 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.08■■□□□ 1.28
SH3BP4-202ENST00000392011 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-202ENST00000392011 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-202ENST00000392011 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-202ENST00000392011 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-202ENST00000392011 SOGA1O94964 1423 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-202ENST00000392011 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP4-202ENST00000392011 NBR1Q14596 966 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP4-202ENST00000392011 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.89■■□□□ 1.26
SH3BP4-202ENST00000392011 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-202ENST00000392011 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-202ENST00000392011 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-202ENST00000392011 CUX2O14529 1486 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP4-202ENST00000392011 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP4-202ENST00000392011 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4-202ENST00000392011 PLEKHG5O94827 1062 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP4-202ENST00000392011 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SH3BP4-202ENST00000392011 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4-202ENST00000392011 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ARXQ96QS3 562 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4-202ENST00000392011 CDCA8Q53HL2 280 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ABCC8Q09428 1581 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-202ENST00000392011 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP4-202ENST00000392011 NEUROD2Q15784 382 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-202ENST00000392011 C14orf37Q86TY3 774 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-202ENST00000392011 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-202ENST00000392011 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-202ENST00000392011 CFAP53Q96M91 514 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-202ENST00000392011 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-202ENST00000392011 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ERCC6Q03468 1493 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-202ENST00000392011 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP4-202ENST00000392011 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4-202ENST00000392011 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4-202ENST00000392011 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4-202ENST00000392011 FOXD1Q16676 465 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP4-202ENST00000392011 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP4-202ENST00000392011 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A0G2JS52 829 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-202ENST00000392011 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-202ENST00000392011 POGKQ9P215 609 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-202ENST00000392011 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-202ENST00000392011 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4-202ENST00000392011 PKD2Q13563 968 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP4-202ENST00000392011 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SH3BP4-202ENST00000392011 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP4-202ENST00000392011 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP4-202ENST00000392011 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4-202ENST00000392011 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4-202ENST00000392011 TMF1P82094 1093 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4-202ENST00000392011 BECN1Q14457 450 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4-202ENST00000392011 RGS3P49796 1198 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4-202ENST00000392011 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4-202ENST00000392011 NUDCQ9Y266 331 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-202ENST00000392011 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP4-202ENST00000392011 CCER2I3L3R5 266 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-202ENST00000392011 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-202ENST00000392011 WIZO95785 1651 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SMARCA2P51531 1590 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-202ENST00000392011 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-202ENST00000392011 GGT6Q6P531 493 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-202ENST00000392011 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-202ENST00000392011 MLECQ14165 292 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-202ENST00000392011 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-202ENST00000392011 FMN1Q68DA7 1419 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-202ENST00000392011 KANK1Q14678 1352 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BP4-202ENST00000392011 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-202ENST00000392011 NUP155O75694 1391 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-202ENST00000392011 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-202ENST00000392011 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-202ENST00000392011 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-202ENST00000392011 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-202ENST00000392011 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-202ENST00000392011 MORC1Q86VD1 984 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-202ENST00000392011 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-202ENST00000392011 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-202ENST00000392011 SOX12O15370 315 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-202ENST00000392011 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.27■■□□□ 1.15
SH3BP4-202ENST00000392011 STK26Q9P289 416 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-202ENST00000392011 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-202ENST00000392011 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-202ENST00000392011 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.23■■□□□ 1.15
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