RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 CEP162Q5TB80 1403 aa27.06■■□□□ 1.92
CCSAP-203ENST00000366687 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CCSAP-203ENST00000366687 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.03■■□□□ 1.92
CCSAP-203ENST00000366687 KCNH8Q96L42 1107 aa26.97■■□□□ 1.91
CCSAP-203ENST00000366687 KIF27Q86VH2 1401 aa26.94■■□□□ 1.9
CCSAP-203ENST00000366687 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.9■■□□□ 1.9
CCSAP-203ENST00000366687 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CCSAP-203ENST00000366687 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
CCSAP-203ENST00000366687 RGL3Q3MIN7 710 aa26.87■■□□□ 1.89
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CCSAP-203ENST00000366687 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.85■■□□□ 1.89
CCSAP-203ENST00000366687 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.84■■□□□ 1.89
CCSAP-203ENST00000366687 NACADO15069 1562 aa26.84■■□□□ 1.89
CCSAP-203ENST00000366687 CDCA8Q53HL2 280 aa26.83■■□□□ 1.89
CCSAP-203ENST00000366687 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CCSAP-203ENST00000366687 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.81■■□□□ 1.88
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP53Q96M91 514 aa26.74■■□□□ 1.87
CCSAP-203ENST00000366687 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CCSAP-203ENST00000366687 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.73■■□□□ 1.87
CCSAP-203ENST00000366687 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.72■■□□□ 1.87
CCSAP-203ENST00000366687 NBR1Q14596 966 aa26.71■■□□□ 1.87
CCSAP-203ENST00000366687 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
CCSAP-203ENST00000366687 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CCSAP-203ENST00000366687 C14orf37Q86TY3 774 aa26.66■■□□□ 1.86
CCSAP-203ENST00000366687 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CCSAP-203ENST00000366687 BECN1Q14457 450 aa26.59■■□□□ 1.85
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.59■■□□□ 1.85
CCSAP-203ENST00000366687 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.57■■□□□ 1.84
CCSAP-203ENST00000366687 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.57■■□□□ 1.84
CCSAP-203ENST00000366687 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.57■■□□□ 1.84
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0G2JS52 829 aa26.56■■□□□ 1.84
CCSAP-203ENST00000366687 ARXQ96QS3 562 aa26.54■■□□□ 1.84
CCSAP-203ENST00000366687 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHG5O94827 1062 aa26.53■■□□□ 1.84
CCSAP-203ENST00000366687 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.52■■□□□ 1.84
CCSAP-203ENST00000366687 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CCSAP-203ENST00000366687 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CCSAP-203ENST00000366687 NUDCQ9Y266 331 aa26.5■■□□□ 1.83
CCSAP-203ENST00000366687 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.49■■□□□ 1.83
CCSAP-203ENST00000366687 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.48■■□□□ 1.83
CCSAP-203ENST00000366687 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.46■■□□□ 1.83
CCSAP-203ENST00000366687 POGKQ9P215 609 aa26.45■■□□□ 1.83
CCSAP-203ENST00000366687 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.45■■□□□ 1.83
CCSAP-203ENST00000366687 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.45■■□□□ 1.83
CCSAP-203ENST00000366687 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CCSAP-203ENST00000366687 ERCC6Q03468 1493 aa26.44■■□□□ 1.82
CCSAP-203ENST00000366687 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.43■■□□□ 1.82
CCSAP-203ENST00000366687 NEUROD2Q15784 382 aa26.43■■□□□ 1.82
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA6L22H0YM25 854 aa26.41■■□□□ 1.82
CCSAP-203ENST00000366687 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CCSAP-203ENST00000366687 CUX2O14529 1486 aa26.4■■□□□ 1.82
CCSAP-203ENST00000366687 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CCSAP-203ENST00000366687 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.36■■□□□ 1.81
CCSAP-203ENST00000366687 SOGA1O94964 1423 aa26.35■■□□□ 1.81
CCSAP-203ENST00000366687 TMF1P82094 1093 aa26.34■■□□□ 1.81
CCSAP-203ENST00000366687 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.34■■□□□ 1.81
CCSAP-203ENST00000366687 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa26.34■■□□□ 1.81
CCSAP-203ENST00000366687 CASC1Q6TDU7 716 aa26.33■■□□□ 1.81
CCSAP-203ENST00000366687 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CCSAP-203ENST00000366687 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CCSAP-203ENST00000366687 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CCSAP-203ENST00000366687 MS4A1P11836 297 aa26.29■■□□□ 1.8
CCSAP-203ENST00000366687 KANK1Q14678 1352 aa26.28■■□□□ 1.8
CCSAP-203ENST00000366687 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CCSAP-203ENST00000366687 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CCSAP-203ENST00000366687 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CCSAP-203ENST00000366687 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.25■■□□□ 1.79
CCSAP-203ENST00000366687 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CCSAP-203ENST00000366687 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.23■■□□□ 1.79
CCSAP-203ENST00000366687 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CCSAP-203ENST00000366687 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.22■■□□□ 1.79
CCSAP-203ENST00000366687 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CCSAP-203ENST00000366687 RGS3P49796 1198 aa26.22■■□□□ 1.79
CCSAP-203ENST00000366687 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
CCSAP-203ENST00000366687 CCER2I3L3R5 266 aa26.19■■□□□ 1.78
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.16■■□□□ 1.78
CCSAP-203ENST00000366687 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CCSAP-203ENST00000366687 PKD2Q13563 968 aa26.14■■□□□ 1.78
CCSAP-203ENST00000366687 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CCSAP-203ENST00000366687 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CCSAP-203ENST00000366687 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.1■■□□□ 1.77
CCSAP-203ENST00000366687 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.1■■□□□ 1.77
CCSAP-203ENST00000366687 MORC1Q86VD1 984 aa26.1■■□□□ 1.77
CCSAP-203ENST00000366687 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.09■■□□□ 1.77
CCSAP-203ENST00000366687 GGT6Q6P531 493 aa26.06■■□□□ 1.76
CCSAP-203ENST00000366687 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.05■■□□□ 1.76
CCSAP-203ENST00000366687 FMN1Q68DA7 1419 aa26.05■■□□□ 1.76
CCSAP-203ENST00000366687 PTMAP06454 111 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CCSAP-203ENST00000366687 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CCSAP-203ENST00000366687 MLECQ14165 292 aa26.04■■□□□ 1.76
CCSAP-203ENST00000366687 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.04■■□□□ 1.76
CCSAP-203ENST00000366687 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.01■■□□□ 1.75
CCSAP-203ENST00000366687 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.99■■□□□ 1.75
CCSAP-203ENST00000366687 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CCSAP-203ENST00000366687 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
CCSAP-203ENST00000366687 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CCSAP-203ENST00000366687 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CCSAP-203ENST00000366687 SMARCA2P51531 1590 aa25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms