RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 TONSLQ96HA7 1378 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-201ENST00000284273 MLECQ14165 292 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-201ENST00000284273 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-201ENST00000284273 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-201ENST00000284273 SCRIBQ14160 1630 aa15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-201ENST00000284273 SOX12O15370 315 aa15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-201ENST00000284273 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
UBASH3B-201ENST00000284273 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.94■□□□□ 0.14
UBASH3B-201ENST00000284273 NBR1Q14596 966 aa15.94■□□□□ 0.14
UBASH3B-201ENST00000284273 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
UBASH3B-201ENST00000284273 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.93■□□□□ 0.14
UBASH3B-201ENST00000284273 TSPY4P0CV99 314 aa15.92■□□□□ 0.14
UBASH3B-201ENST00000284273 TSPY10P0CW01 314 aa15.92■□□□□ 0.14
UBASH3B-201ENST00000284273 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.14
UBASH3B-201ENST00000284273 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
UBASH3B-201ENST00000284273 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.86■□□□□ 0.13
UBASH3B-201ENST00000284273 NEUROD2Q15784 382 aa15.85■□□□□ 0.13
UBASH3B-201ENST00000284273 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-201ENST00000284273 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.8■□□□□ 0.12
UBASH3B-201ENST00000284273 CLSTN1O94985 981 aa15.79■□□□□ 0.12
UBASH3B-201ENST00000284273 MRS2Q9HD23 443 aa15.78■□□□□ 0.12
UBASH3B-201ENST00000284273 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
UBASH3B-201ENST00000284273 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.11
UBASH3B-201ENST00000284273 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
UBASH3B-201ENST00000284273 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-201ENST00000284273 NCLP19338 710 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
UBASH3B-201ENST00000284273 POGKQ9P215 609 aa15.73■□□□□ 0.11
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
UBASH3B-201ENST00000284273 GOLGA2Q08379 1002 aa15.7■□□□□ 0.1
UBASH3B-201ENST00000284273 ERCC6Q03468 1493 aa15.67■□□□□ 0.1
UBASH3B-201ENST00000284273 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.67■□□□□ 0.1
UBASH3B-201ENST00000284273 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
UBASH3B-201ENST00000284273 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
UBASH3B-201ENST00000284273 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
UBASH3B-201ENST00000284273 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
UBASH3B-201ENST00000284273 STK26Q9P289 416 aa15.61■□□□□ 0.09
UBASH3B-201ENST00000284273 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
UBASH3B-201ENST00000284273 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
UBASH3B-201ENST00000284273 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-201ENST00000284273 PLCB2Q00722 1185 aa15.58■□□□□ 0.09
UBASH3B-201ENST00000284273 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-201ENST00000284273 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-201ENST00000284273 FGD1P98174 961 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-201ENST00000284273 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-201ENST00000284273 CFAP53Q96M91 514 aa15.55■□□□□ 0.08
UBASH3B-201ENST00000284273 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
UBASH3B-201ENST00000284273 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.54■□□□□ 0.08
UBASH3B-201ENST00000284273 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.53■□□□□ 0.08
UBASH3B-201ENST00000284273 APBB1O00213 710 aa15.52■□□□□ 0.07
UBASH3B-201ENST00000284273 KCNJ4P48050 445 aa15.52■□□□□ 0.07
UBASH3B-201ENST00000284273 GGT6Q6P531 493 aa15.52■□□□□ 0.07
UBASH3B-201ENST00000284273 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
UBASH3B-201ENST00000284273 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.51■□□□□ 0.07
UBASH3B-201ENST00000284273 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
UBASH3B-201ENST00000284273 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
UBASH3B-201ENST00000284273 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
UBASH3B-201ENST00000284273 PDE4CQ08493 712 aa15.48■□□□□ 0.07
UBASH3B-201ENST00000284273 CASC1Q6TDU7 716 aa15.48■□□□□ 0.07
UBASH3B-201ENST00000284273 PTMAP06454 111 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBASH3B-201ENST00000284273 RGS3P49796 1198 aa15.47■□□□□ 0.07
UBASH3B-201ENST00000284273 NUTM2FA1L443 756 aa15.47■□□□□ 0.07
UBASH3B-201ENST00000284273 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa15.46■□□□□ 0.07
UBASH3B-201ENST00000284273 PRM3Q9NNZ6 103 aa15.46■□□□□ 0.07
UBASH3B-201ENST00000284273 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
UBASH3B-201ENST00000284273 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
UBASH3B-201ENST00000284273 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
UBASH3B-201ENST00000284273 MIER1Q8N108 512 aa15.43■□□□□ 0.06
UBASH3B-201ENST00000284273 KLHL34Q8N239 644 aa15.43■□□□□ 0.06
UBASH3B-201ENST00000284273 MSH5O43196 834 aa15.42■□□□□ 0.06
UBASH3B-201ENST00000284273 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
UBASH3B-201ENST00000284273 CHMP3Q9Y3E7 222 aa15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-201ENST00000284273 G3V3G9 751 aa15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-201ENST00000284273 DCAF8Q5TAQ9 597 aa15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-201ENST00000284273 NUDCQ9Y266 331 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-201ENST00000284273 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-201ENST00000284273 BECN1Q14457 450 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-201ENST00000284273 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-201ENST00000284273 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
UBASH3B-201ENST00000284273 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.36■□□□□ 0.05
UBASH3B-201ENST00000284273 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
UBASH3B-201ENST00000284273 GOLGA6L22H0YM25 854 aa15.34■□□□□ 0.05
UBASH3B-201ENST00000284273 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
UBASH3B-201ENST00000284273 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
UBASH3B-201ENST00000284273 FOXD1Q16676 465 aa15.33■□□□□ 0.04
UBASH3B-201ENST00000284273 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
UBASH3B-201ENST00000284273 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
UBASH3B-201ENST00000284273 CLIP1P30622 1438 aa15.31■□□□□ 0.04
UBASH3B-201ENST00000284273 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
UBASH3B-201ENST00000284273 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
UBASH3B-201ENST00000284273 CDCA8Q53HL2 280 aa15.29■□□□□ 0.04
UBASH3B-201ENST00000284273 MORC1Q86VD1 984 aa15.27■□□□□ 0.04
UBASH3B-201ENST00000284273 WWC1Q8IX03 1113 aa15.27■□□□□ 0.04
UBASH3B-201ENST00000284273 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.27■□□□□ 0.03
UBASH3B-201ENST00000284273 FBXO3Q9UK99 471 aa15.26■□□□□ 0.03
UBASH3B-201ENST00000284273 VPS53Q5VIR6 699 aa15.26■□□□□ 0.03
UBASH3B-201ENST00000284273 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
UBASH3B-201ENST00000284273 TAF7LQ5H9L4 462 aa15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.9 ms