RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZTC4 211 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BNG1 76 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-206ENST00000588815 HTN3P15516 51 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-206ENST00000588815 VSIG2Q96IQ7 327 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-206ENST00000588815 AKR1D1P51857 326 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM97Q5BJF2 176 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-206ENST00000588815 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-206ENST00000588815 GTSF1LQ9H1H1 148 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-206ENST00000588815 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TOMM6Q96B49 74 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-206ENST00000588815 CYSLTR1Q9Y271 337 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf66Q6UXQ4 117 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SH2D6Q7Z4S9 175 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-206ENST00000588815 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-206ENST00000588815 C20orf203Q8NBC4 194 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0J9YY99 117 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP5LO75964 103 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV10A0A0B4J240 114 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-206ENST00000588815 ICOSQ9Y6W8 199 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-206ENST00000588815 CHCHD7Q9BUK0 85 aa21.64■■□□□ 1.06
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAH9Q9NYC9 4486 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 ERASQ7Z444 233 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 IFI27L1Q96BM0 104 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 C3orf79P0CE67 100 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 SCGB3A1Q96QR1 104 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 KRTDAPP60985 99 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00173Q6ZV60 143 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 TIMM17AQ99595 171 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 SMAGPQ0VAQ4 97 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL39P62891 51 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM141Q96I45 108 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 H7C423 109 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 NPSP0C0P6 89 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA12Q7Z6I5 190 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 COL7A1Q02388 2944 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A096LPF7 62 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-206ENST00000588815 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-206ENST00000588815 PET117Q6UWS5 81 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM243Q9BU79 118 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-206ENST00000588815 IGIPA6NJ69 53 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-206ENST00000588815 TIMM21Q9BVV7 248 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-206ENST00000588815 SPANXA1Q9NS26 97 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZN92 141 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-206ENST00000588815 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM6P0DI80 62 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-206ENST00000588815 C20orf202A1L168 122 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-206ENST00000588815 TIRAPP58753 221 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-206ENST00000588815 PYY3Q5JQD4 70 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-206ENST00000588815 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-206ENST00000588815 C15orf53Q8NAA6 179 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2L6O14933 153 aa21.52■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa21.52■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS1P07477 247 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 SCGB1D1O95968 90 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC01545Q5VT33 79 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 LGALS9CQ6DKI2 356 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 STAB2Q8WWQ8 2551 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 BAALCQ8WXS3 180 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 FGF6P10767 208 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 LELP1Q5T871 98 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 Q8N976 141 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 H0Y8G0 127 aa21.45■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa21.45■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 CHCHD5Q9BSY4 110 aa21.45■■□□□ 1.03
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-206ENST00000588815 PKIAP61925 76 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-206ENST00000588815 PMVKQ15126 192 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-206ENST00000588815 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-206ENST00000588815 LYPD5Q6UWN5 251 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A087WX48 190 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM101Q96IK0 257 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-206ENST00000588815 ODF1Q14990 250 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-206ENST00000588815 VCX2Q9H322 139 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5A1Q8NGJ0 315 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-206ENST00000588815 AMELXQ99217 191 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GUV1 79 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-206ENST00000588815 GAGE6Q13070 117 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-206ENST00000588815 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX43Q6ZNM6 134 aa21.39■■□□□ 1.01
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