RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514275.5

IFT122-231, Transcript of intraflagellar transport 122, human

TSL 5

Gene IFT122, Length 296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT122-231	ENST00000514275	C16orf95	Q9H693	158 aa		3.6	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		3.6	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	PIEZO1	Q92508	2521 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275		H3BMG7	143 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	CCL24	O00175	119 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	TSPAN13	O95857	204 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	INS	P01308	110 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	HTN1	P15515	57 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	UBE2D3	P61077	147 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	UBE2D2	P62837	147 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	SCGB2A2	Q13296	93 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	FHL3	Q13643	280 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	IL17D	Q8TAD2	202 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	ESM1	Q9NQ30	184 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		3.59	□□□□□ -1.83
IFT122-231	ENST00000514275	CR1	P17927	2039 aa		3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275		A0A0J9YXY3	114 aa		3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	TIRAP	P58753	221 aa		3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	LITAF	Q99732	161 aa		3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		3.57	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275		A4D1N5	150 aa		3.57	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	APOM	O95445	188 aa		3.57	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	IGHV3-33	P01772	117 aa		3.57	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		3.57	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	PSMB2	P49721	201 aa		3.57	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	FLNC	Q14315	2725 aa		3.57	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		3.57	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	VPS13C	Q709C8	3753 aa		3.57	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		3.57	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		3.57	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	COL12A1	Q99715	3063 aa		3.57	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	XCL2	Q9UBD3	114 aa		3.57	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	3.56	□□□□□ -1.84	1e-10	■■■■■ 43.2
IFT122-231	ENST00000514275	AGRN	O00468	2067 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275		A0A0B4J2C4	111 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275		A0A1W2PRX2	142 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	TIMM17B	O60830	172 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	TCL1B	O95988	128 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	COTL1	Q14019	142 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	ETDB	Q3ZM63	59 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	STH	Q8IWL8	128 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	LINC01006	Q8NI28	216 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	RNF183	Q96D59	192 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	CARD19	Q96LW7	228 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	LINC01600	Q96MT4	127 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	SPANXC	Q9NY87	97 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	ERG28	Q9UKR5	140 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	ZFHX3	Q15911	3703 aa		3.56	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	SPG11	Q96JI7	2443 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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