RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512673.1

ALYREF-204, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 2

Gene ALYREF, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-204ENST00000512673 OTORQ9NRC9 128 aa9.55□□□□□ -0.88
ALYREF-204ENST00000512673 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.54□□□□□ -0.88
ALYREF-204ENST00000512673 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.54□□□□□ -0.88
ALYREF-204ENST00000512673 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ALYREF-204ENST00000512673 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa9.54□□□□□ -0.88
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ALYREF-204ENST00000512673 SGK494Q96LW2 274 aa9.54□□□□□ -0.88
ALYREF-204ENST00000512673 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.54□□□□□ -0.88
ALYREF-204ENST00000512673 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.53□□□□□ -0.88
ALYREF-204ENST00000512673 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa9.53□□□□□ -0.88
ALYREF-204ENST00000512673 PEX7O00628 323 aa9.53□□□□□ -0.88
ALYREF-204ENST00000512673 AKR1C3P42330 323 aa9.53□□□□□ -0.88
ALYREF-204ENST00000512673 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.53□□□□□ -0.88
ALYREF-204ENST00000512673 DERL1Q9BUN8 251 aa9.53□□□□□ -0.88
ALYREF-204ENST00000512673 EPDR1Q9UM22 224 aa9.53□□□□□ -0.88
ALYREF-204ENST00000512673 A8MWV9 139 aa9.52□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 GNG4P50150 75 aa9.52□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.52□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.52□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.52□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 OCC1Q8TAD7 63 aa9.52□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 SFRP2Q96HF1 295 aa9.52□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 FMC1Q96HJ9 113 aa9.52□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 BIN3Q9NQY0 253 aa9.52□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 GCGP01275 180 aa9.51□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 RAB5AP20339 215 aa9.51□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 S100PP25815 95 aa9.51□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 CACNG7P62955 275 aa9.51□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 PTH2Q96A98 100 aa9.51□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.51□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 OSTCQ9NRP0 149 aa9.51□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 TCRAP04437 139 aa9.5□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 CENPWQ5EE01 88 aa9.5□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 Q6ZRP5 223 aa9.5□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.5□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa9.5□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.49□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 UBE2D3P61077 147 aa9.49□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 UBE2D2P62837 147 aa9.49□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.49□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 OR10G8Q8NGN5 311 aa9.49□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 PRR34Q9NV39 138 aa9.49□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 A0A096LNI7 61 aa9.48□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.48□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 K7EN84 100 aa9.48□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 K7EQM0 130 aa9.48□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 RAB5BP61020 215 aa9.48□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 UBE2G1P62253 170 aa9.48□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 GNG5P63218 68 aa9.48□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.48□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 MLST8Q9BVC4 326 aa9.48□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 LTAP01374 205 aa9.47□□□□□ -0.89
ALYREF-204ENST00000512673 RBX1P62877 108 aa9.46□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 GAGE6Q13070 117 aa9.46□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 COX8CQ7Z4L0 72 aa9.46□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 BAGE2Q86Y30 109 aa9.46□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 IL36BQ9NZH7 164 aa9.46□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.46□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa9.45□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 COX19Q49B96 90 aa9.45□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 CT83Q5H943 113 aa9.45□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.45□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 V9GYV3 84 aa9.45□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.44□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 CXCL1P09341 107 aa9.44□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 S100A4P26447 101 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 Q86TA4 180 aa9.44□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.43□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 REG3AQ06141 175 aa9.43□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.43□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.42□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 H3BVH4 76 aa9.42□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 RHODO00212 210 aa9.42□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 RASL11AQ6T310 242 aa9.42□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 C15orf56Q8N910 161 aa9.42□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 MUC17Q685J3 4493 aa9.42□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.41□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.41□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.41□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.41□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.4□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.4□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 PSG8Q9UQ74 426 aa9.4□□□□□ -0.9
ALYREF-204ENST00000512673 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.39□□□□□ -0.91
ALYREF-204ENST00000512673 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
ALYREF-204ENST00000512673 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.39□□□□□ -0.91
ALYREF-204ENST00000512673 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.39□□□□□ -0.91
ALYREF-204ENST00000512673 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.39□□□□□ -0.91
ALYREF-204ENST00000512673 TSKUQ8WUA8 353 aa9.39□□□□□ -0.91
ALYREF-204ENST00000512673 NUDT11Q96G61 164 aa9.39□□□□□ -0.91
ALYREF-204ENST00000512673 A8MWL6 223 aa9.38□□□□□ -0.91
ALYREF-204ENST00000512673 MT-ND6P03923 174 aa9.38□□□□□ -0.91
ALYREF-204ENST00000512673 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.38□□□□□ -0.91
ALYREF-204ENST00000512673 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
ALYREF-204ENST00000512673 C5orf52A6NGY3 159 aa9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.5 ms