RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 TENM4Q6N022 2769 aa2.88□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 KALRNO60229 2985 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 AKAP13Q12802 2813 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A1B0GWB2 263 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 NDUFA4O00483 81 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 RS1O15537 224 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 ATP5LO75964 103 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 DPM2O94777 84 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGKCP01834 107 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 CKS2P33552 79 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 LEPP41159 167 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 NMUP48645 174 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM78Q5T7P6 136 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 C16orf74Q96GX8 76 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 CHAC1Q9BUX1 264 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 CNFNQ9BYD5 112 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 GTSF1LQ9H1H1 148 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 MAP1LC3AQ9H492 121 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 VPREB3Q9UKI3 123 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 PKDREJQ9NTG1 2253 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 ROS1P08922 2347 aa2.87□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 NOTCH2Q04721 2471 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 FABP5P3A8MUU1 101 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 J3QR89 54 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 K7ERJ3 54 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 M0R3E3 92 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGHG4P01861 327 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 ORM1P02763 201 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 TCTAP57738 103 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 SMAGPQ0VAQ4 97 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 RRN3P1Q2M238 152 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 Q8N8P6 123 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR10J6PQ8NGY7 276 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM158Q8WZ71 300 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 TTTY13Q9BZ97 58 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 UFC1Q9Y3C8 167 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 TEX15Q9BXT5 2789 aa2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A087WX48 190 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A1B0GV72 72 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 RBAKDNA6NC62 111 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 OVOL1O14753 267 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 BRI3O95415 125 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 CKS1BP61024 79 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 KLK9Q2XQG4 91 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC01006Q8NI28 216 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 MYOZ3Q8TDC0 251 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC00477Q96M19 166 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 FOXC2Q99958 501 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 KLK9Q9UKQ9 250 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 CFAP46Q8IYW2 2715 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 ABCA12Q86UK0 2595 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 PLXNB1O43157 2135 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 RELNP78509 3460 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 H3BMG7 143 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 K7EMI3 77 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 K7EMT4 169 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 S100A4P26447 101 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 HLA-DMBP28068 263 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 INSL3P51460 131 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 ERCC8Q13216 396 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 ETDBQ3ZM63 59 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 GPHB5Q86YW7 130 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 RNF182Q8N6D2 247 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 WFDC11Q8NEX6 87 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 MRAP2Q96G30 205 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 UBE2E2Q96LR5 201 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 CARD19Q96LW7 228 aa2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1-209ENST00000498399 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.2 ms