RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	HMSD	A8MTL9	139 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651		H0Y9J4	135 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGLV7-43	P04211	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	AKR1D1	P51857	326 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	UQCC3	Q6UW78	93 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	DERL1	Q9BUN8	251 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	BIN3	Q9NQY0	253 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	IL36B	Q9NZH7	164 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	APOC3	P02656	99 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	TCRA	P04437	139 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	AMT	P48728	403 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	GAGE2B	Q13066	116 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMUB2	Q71RG4	321 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	SVBP	Q8N300	66 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	MITD1	Q8WV92	249 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651		A4D1N5	150 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651		B4DEV8	164 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARPC5	O15511	151 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	NDUFB6	O95139	128 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651		P01737	135 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	BTC	P35070	178 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	IL15RA	Q13261	267 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	DIRC1	Q969H9	104 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	SNAPIN	O95295	136 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	MPC2	O95563	127 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF56	Q15929	161 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATP6V1F	Q16864	119 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAB19	A4D1S5	217 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	S100A6	P06703	90 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	BCL2	P10415	239 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAB5B	P61020	215 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	SST	P61278	116 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	KHDC3L	Q587J8	217 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	STX12	Q86Y82	276 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	BCL2L11	O43521	198 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	SH2D1A	O60880	128 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	S100A8	P05109	93 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	PCP4	P48539	62 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	SULT1A2	P50226	295 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAB4B	P61018	213 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAB2A	P61019	212 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	HBG1	P69891	147 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	HBG2	P69892	147 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	CTAG1A	P78358	180 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	STOML3	Q8TAV4	291 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	CARD19	Q96LW7	228 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	AQP10	Q96PS8	301 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A087X002	238 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM168B	A1KXE4	195 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651		F8W036	122 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651		H0YIZ8	118 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	PET100	P0DJ07	73 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	GZMB	P10144	247 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBE2D1	P51668	147 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	PKIA	P61925	76 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF345	Q14585	488 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	C12orf57	Q99622	126 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	EPDR1	Q9UM22	224 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A087WZ39	114 aa		5.01	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms