RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
LRRTM4-202ENST00000409093 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.42□□□□□ -1.22
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.41□□□□□ -1.22
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.41□□□□□ -1.22
LRRTM4-202ENST00000409093 M0R381 172 aa7.41□□□□□ -1.22
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP5LO75964 103 aa7.41□□□□□ -1.22
LRRTM4-202ENST00000409093 KNCNA6PVL3 124 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-202ENST00000409093 INAFM1C9JVW0 142 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-202ENST00000409093 NPYP01303 97 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-202ENST00000409093 MED14OSP0DP75 135 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-202ENST00000409093 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-202ENST00000409093 SPRY2O43597 315 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 CD7P09564 240 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 K7EMI3 77 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 HLA-DRB4P13762 266 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 PROK1P58294 105 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 TIRAPP58753 221 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 TEN1Q86WV5 123 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 MUC4Q99102 2169 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 GAS8-AS1O95177 125 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 HIVEP1P15822 2718 aa7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 H3BMM0 161 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 FXYD7P58549 80 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 PCP2Q8IVA1 136 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 JPT2Q9H910 190 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 A8MTW9 85 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 NXPH4O95158 308 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 MGPP08493 103 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 RRN3P1Q2M238 152 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 Q8N1Y9 231 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 M0R2P5 195 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 OXTP01178 125 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 NRACQ8N912 160 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 IL17DQ8TAD2 202 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A096LNJ9 63 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 HBDP02042 147 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 C12orf74Q32Q52 190 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 C9orf85Q96MD7 179 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.34□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.34□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.34□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.34□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM236CP0DP71 79 aa7.34□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 CEND1Q8N111 149 aa7.34□□□□□ -1.23
LRRTM4-202ENST00000409093 JMJD1CQ15652 2540 aa7.34□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 HTN1P15515 57 aa7.33□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 KRTAP10-3P60369 221 aa7.33□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.33□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.33□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 Q8N8P6 123 aa7.33□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 DPH3Q96FX2 82 aa7.33□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF747Q9BV97 191 aa7.33□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.33□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.33□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.33□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 SPANXCQ9NY87 97 aa7.33□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 HIGD1BQ9P298 99 aa7.33□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC01546A6NGU7 62 aa7.32□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 C1orf195Q5TG92 126 aa7.32□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 STHQ8IWL8 128 aa7.32□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.32□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.32□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A087WWL8 130 aa7.32□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 UQCRQO14949 82 aa7.32□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 INSP01308 110 aa7.32□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 IGLV1-51P01701 117 aa7.32□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 PF4P02776 101 aa7.32□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.32□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.32□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 PSMB2P49721 201 aa7.31□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.31□□□□□ -1.24
LRRTM4-202ENST00000409093 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.4 ms