RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384664.1

RNU6-1060P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1060, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1060P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1060P-201ENST00000384664 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PYDC1Q8WXC3 89 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SPTSSAQ969W0 71 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SMIM3Q9BZL3 60 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1060P-201ENST00000384664 BCE1O60756 84 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SPRR2BP35325 72 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CKS1BP61024 79 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1060P-201ENST00000384664 FHAD1B1AJZ9 1412 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1060P-201ENST00000384664 C10orf71Q711Q0 1435 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PLCE1Q9P212 2302 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1060P-201ENST00000384664 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.85□□□□□ -2.54
RNU6-1060P-201ENST00000384664 BSNQ9UPA5 3926 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 NPFFO15130 113 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CHD6Q8TD26 2715 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 I3L2K1 104 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 M0R2Z0 102 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SIX6O95475 246 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 NPVFQ9HCQ7 196 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 USF3Q68DE3 2245 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SNCGO76070 127 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SMIM4Q8WVI0 70 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 R4GMQ9 66 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CEP152O94986 1710 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MRC1P22897 1456 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ERCC6L2Q5T890 1561 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ARPC5O15511 151 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 S100A3P33764 101 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 S100A7L2Q5SY68 101 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SPEF2Q9C093 1822 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 K7ERU9 68 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 M0R135 149 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PPP1R17O96001 155 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 AKAP14Q86UN6 197 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PATJQ8NI35 1801 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ZNF236Q9UL36 1845 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PAPPAQ13219 1627 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 HAMPP81172 84 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 DCDP81605 110 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 DR1Q01658 176 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 KCNRGQ8N5I3 272 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SDF2Q99470 211 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SEC11CQ9BY50 192 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 DOCK1Q14185 1865 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1060P-201ENST00000384664 HCG22E2RYF7 251 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 K7EQZ3 153 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 LENEPQ9Y5L5 61 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 COL6A3P12111 3177 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SBF2Q86WG5 1849 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 RPS25P62851 125 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TCEAL4Q96EI5 215 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 AMELXQ99217 191 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TSC2P49815 1807 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 DOCK2Q92608 1830 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SPAG11AQ6PDA7 123 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 LINC00472Q9H8W2 130 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 COPZ2Q9P299 210 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 COPZ1P61923 177 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 COX17Q14061 63 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PIGYQ3MUY2 71 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TSTD1Q8NFU3 115 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 LZICQ8WZA0 190 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 DPH3Q96FX2 82 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 AQP10Q96PS8 301 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CCDC167Q9P0B6 97 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 GRIN2AQ12879 1464 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PI4KAP42356 2102 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SMCO1Q147U7 214 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SMIM21Q3B7S5 101 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 C10orf128Q5T292 105 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 V9GYH0 126 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 WDR7Q9Y4E6 1490 aa-0.97□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.4 ms