RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNRF1Q8ND25 227 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 TNCP24821 2201 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB133Q30KQ1 61 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 DSPP15924 2871 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 COL6A6A6NMZ7 2263 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 ATMQ13315 3056 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV3A0A0B4J244 114 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 COX6B1P14854 86 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00846Q9NV44 126 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB108AA8MXU0 73 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6JHZ5 121 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 TOMM6Q96B49 74 aa4.93□□□□□ -1.62
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RABGEF1-202ENST00000380828 GAS8-AS1O95177 125 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 Q1T7F1 81 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB108BQ8NET1 73 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 ACACAQ13085 2346 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 SPTBN4Q9H254 2564 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 DCHS2Q6V1P9 2916 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 MIFP14174 115 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM167BQ9NRX6 74 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 C22orf24Q9Y442 160 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 ITPR1Q14643 2758 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 INAFM1C9JVW0 142 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 CKS2P33552 79 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 K7EQG2 157 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 PCNX1Q96RV3 2341 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 SORL1Q92673 2214 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-43DP0DP04 118 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV12-3P01733 135 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 NDPQ00604 133 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGEF1-202ENST00000380828 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF575Q86XF7 245 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 CELA1Q9UNI1 258 aa4.9□□□□□ -1.63
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RABGEF1-202ENST00000380828 LHBP01229 141 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV3-11P04433 115 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA0087Q14695 138 aa4.9□□□□□ -1.63
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RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.89□□□□□ -1.63
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RABGEF1-202ENST00000380828 Q8N6K4 173 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 DAND5Q8N907 189 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 HCG22E2RYF7 251 aa4.89□□□□□ -1.63
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RABGEF1-202ENST00000380828 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.88□□□□□ -1.63
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RABGEF1-202ENST00000380828 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa4.88□□□□□ -1.63
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RABGEF1-202ENST00000380828 Q75L30 129 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 J3QL48 77 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 APELAP0DMC3 54 aa4.87□□□□□ -1.63
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RABGEF1-202ENST00000380828 Q5VV11 94 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZTC4 211 aa4.87□□□□□ -1.63
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RABGEF1-202ENST00000380828 I3L3M4 83 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 BSPH1Q075Z2 132 aa4.87□□□□□ -1.63
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