RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 SFRP2Q96HF1 295 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 ZFHX3Q15911 3703 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 OTOGQ6ZRI0 2925 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 LCE6AA0A183 80 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 COX19Q49B96 90 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 CBLN2Q8IUK8 224 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 GAGE12HA6NDE8 117 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf196B1AJZ1 125 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 SEC11AP67812 179 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 AMN1Q8IY45 258 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 PFN2P35080 140 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 LELP1Q5T871 98 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 COX7A2LO14548 114 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 PPBPP02775 128 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 REG3AQ06141 175 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01551Q86U37 167 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf52Q96A22 123 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TENM2Q9NT68 2774 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 XGP55808 180 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 ODF3Q96PU9 254 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 CRYBA4P53673 196 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 KRTDAPP60985 99 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TENM3Q9P273 2699 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 MT-ND6P03923 174 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 ESRGQ1W209 222 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 ORMDL2Q53FV1 153 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TSKUQ8WUA8 353 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 ORAOV1Q8WV07 137 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 CST9LQ9H4G1 147 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GV90 55 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GW15 77 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 GAGE10A6NGK3 116 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 FGF6P10767 208 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00315P59091 139 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 X6R8D5 127 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 CCL25O15444 150 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2AP49459 152 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 Q8NAQ8 132 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 IMMP2LQ96T52 175 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 OSTCQ9NRP0 149 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TGP01266 2768 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 D6R8Y8 96 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2D1P51668 147 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 SPAG11BQ08648 103 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TDRG1Q3Y452 100 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 PDZD11Q5EBL8 140 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa3.15□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 K7EN84 100 aa3.15□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC30Q96LL9 226 aa3.15□□□□□ -1.9
PTPRC-201ENST00000348564 SCGB1D1O95968 90 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 MIAQ16674 131 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 LYPD5Q6UWN5 251 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 TIMM17AQ99595 171 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFA1O15239 70 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 RS1O15537 224 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 LTAP01374 205 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 GCSHP23434 173 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 RBX1P62877 108 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 HAMPP81172 84 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 SUMO4Q6EEV6 95 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 RASL10AQ92737 203 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 A8MZ25 164 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 CFAP126Q5VTH2 177 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00526Q96FQ7 95 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 EPM2AB3EWF7 344 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 TNFRSF6BO95407 300 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 AKAP9Q99996 3911 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM12Q96EX1 92 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 PTTG1IPP53801 180 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 SYCNQ0VAF6 134 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 LAGE3Q14657 143 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-201ENST00000348564 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms