RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 ZNRF2Q8NHG8 242 aa16.23■□□□□ 0.19
VSTM4-201ENST00000298454 K7EQD1 137 aa16.23■□□□□ 0.19
VSTM4-201ENST00000298454 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
VSTM4-201ENST00000298454 PMVKQ15126 192 aa16.23■□□□□ 0.19
VSTM4-201ENST00000298454 PRIMA1Q86XR5 153 aa16.23■□□□□ 0.19
VSTM4-201ENST00000298454 BOD1L2Q8IYS8 172 aa16.23■□□□□ 0.19
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A29Q8N8R3 303 aa16.23■□□□□ 0.19
VSTM4-201ENST00000298454 CST9LQ9H4G1 147 aa16.23■□□□□ 0.19
VSTM4-201ENST00000298454 X6R8D5 127 aa16.23■□□□□ 0.19
VSTM4-201ENST00000298454 C2orf91Q6ZV80 131 aa16.22■□□□□ 0.19
VSTM4-201ENST00000298454 CHCHD7Q9BUK0 85 aa16.21■□□□□ 0.19
VSTM4-201ENST00000298454 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
VSTM4-201ENST00000298454 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa16.2■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1B0GV90 55 aa16.2■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 C3orf56Q8N813 242 aa16.2■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 TTTY13Q9BZ97 58 aa16.2■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa16.2■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa16.19■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 COTL1Q14019 142 aa16.19■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 DEFB135Q30KP9 77 aa16.19■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 OXLD1Q5BKU9 147 aa16.18■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa16.18■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa16.17■□□□□ 0.18
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VSTM4-201ENST00000298454 MPV17L2Q567V2 206 aa16.17■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 C11orf86A6NJI1 115 aa16.17■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 APOC4P55056 127 aa16.17■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 GAGE12JA6NER3 117 aa16.16■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 DLEU1O43261 78 aa16.16■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 DEFB130BP0DP73 79 aa16.16■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 DEFB130AP0DP74 79 aa16.16■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 GAGE1Q13065 139 aa16.16■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 GAGE4Q13068 117 aa16.16■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 GAGE5Q13069 117 aa16.16■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 GAGE13Q4V321 117 aa16.16■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 FAM104AQ969W3 186 aa16.16■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa16.15■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 SMIM9A6NGZ8 99 aa16.15■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa16.15■□□□□ 0.18
VSTM4-201ENST00000298454 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa16.14■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa16.14■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa16.14■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 CIDEAO60543 219 aa16.13■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 UBE2D3P61077 147 aa16.13■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 UBE2D2P62837 147 aa16.13■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 FHL2Q14192 279 aa16.13■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 SHISA2Q6UWI4 295 aa16.13■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa16.13■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa16.13■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa16.13■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 VCX2Q9H322 139 aa16.13■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 C12orf54Q6X4T0 127 aa16.12■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 LINC00612Q8N6U2 182 aa16.12■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa16.12■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa16.11■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 OR11H2Q8NH07 326 aa16.11■□□□□ 0.17
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VSTM4-201ENST00000298454 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa16.11■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa16.11■□□□□ 0.17
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VSTM4-201ENST00000298454 DEFB4AO15263 64 aa16.1■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 SIVA1O15304 175 aa16.1■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 KRTAP10-11P60412 298 aa16.1■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa16.1■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM97Q5BJF2 176 aa16.1■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 STAB1Q9NY15 2570 aa16.09■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 AMELXQ99217 191 aa16.09■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 SPANXA1Q9NS26 97 aa16.09■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 E9PLD3 99 aa16.09■□□□□ 0.17
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM170BQ5T4T1 132 aa16.08■□□□□ 0.16
VSTM4-201ENST00000298454 FAM222AQ5U5X8 452 aa16.08■□□□□ 0.16
VSTM4-201ENST00000298454 PRADC1Q9BSG0 188 aa16.08■□□□□ 0.16
VSTM4-201ENST00000298454 CHAC1Q9BUX1 264 aa16.08■□□□□ 0.16
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VSTM4-201ENST00000298454 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa16.07■□□□□ 0.16
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VSTM4-201ENST00000298454 Q6ZUT4 128 aa16.07■□□□□ 0.16
VSTM4-201ENST00000298454 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa16.06■□□□□ 0.16
VSTM4-201ENST00000298454 LINC00694P0DN24 101 aa16.06■□□□□ 0.16
VSTM4-201ENST00000298454 CMYA5Q8N3K9 4069 aa16.05■□□□□ 0.16
VSTM4-201ENST00000298454 NPSP0C0P6 89 aa16.05■□□□□ 0.16
VSTM4-201ENST00000298454 CRYBA4P53673 196 aa16.04■□□□□ 0.16
VSTM4-201ENST00000298454 LYRM9A8MSI8 78 aa16.03■□□□□ 0.16
VSTM4-201ENST00000298454 Q8NAQ8 132 aa16.03■□□□□ 0.16
VSTM4-201ENST00000298454 RNF183Q96D59 192 aa16.03■□□□□ 0.16
VSTM4-201ENST00000298454 HERVK_113P61574 105 aa16.03■□□□□ 0.16
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
VSTM4-201ENST00000298454 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa16.02■□□□□ 0.16
VSTM4-201ENST00000298454 HSD52Q0P140 79 aa16.02■□□□□ 0.16
VSTM4-201ENST00000298454 SBSPONQ8IVN8 264 aa16.02■□□□□ 0.16
VSTM4-201ENST00000298454 HIGD1BQ9P298 99 aa16.02■□□□□ 0.16
VSTM4-201ENST00000298454 MAST4O15021 2626 aa16.02■□□□□ 0.15
VSTM4-201ENST00000298454 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa16.02■□□□□ 0.15
VSTM4-201ENST00000298454 GTSF1LQ9H1H1 148 aa16.02■□□□□ 0.15
VSTM4-201ENST00000298454 MIFP14174 115 aa16.01■□□□□ 0.15
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