RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294599.8

MEGF6-201, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MEGF6, Length 4,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-201ENST00000294599 H0YGX0 51 aa12.37□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 C11orf21Q9P2W6 132 aa12.37□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 G3V4G9 280 aa12.37□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 RBX1P62877 108 aa12.37□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 DEFB113Q30KQ7 82 aa12.36□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 ESM1Q9NQ30 184 aa12.36□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa12.36□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 A6NDX4 124 aa12.36□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa12.35□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa12.35□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 C16orf74Q96GX8 76 aa12.35□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 SS18L2Q9UHA2 77 aa12.35□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa12.34□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 PIFOQ8TCI5 191 aa12.34□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 CLEC2BQ92478 149 aa12.34□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 CDSNQ15517 529 aa12.34□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 NDUFA11Q86Y39 141 aa12.34□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 COX7B2Q8TF08 81 aa12.34□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 TM2D2Q9BX73 214 aa12.34□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa12.34□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 C19orf84I3L1E1 186 aa12.34□□□□□ -0.43
MEGF6-201ENST00000294599 J3QKU1 62 aa12.33□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa12.33□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 PRB1P04280 392 aa12.32□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 LGALS9O00182 355 aa12.32□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 COX7A2LO14548 114 aa12.32□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa12.32□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa12.32□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 Q9HAA7 133 aa12.32□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 H3BT86 120 aa12.32□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa12.32□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa12.31□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa12.31□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa12.31□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 LECT2O14960 151 aa12.31□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 NRACQ8N912 160 aa12.31□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa12.3□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 PRR9Q5T870 116 aa12.3□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 C1orf43Q9BWL3 253 aa12.3□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 TMEM89A2RUT3 159 aa12.3□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 P0DMU3 169 aa12.3□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 FAM231AP0DMU4 169 aa12.3□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 FAM231CP0DMU5 169 aa12.3□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 ATP5G1P05496 136 aa12.3□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 Q6ZUT4 128 aa12.3□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 SMIM20Q8N5G0 67 aa12.29□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 hADV29S1A0JD25 119 aa12.29□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 TCL1BO95988 128 aa12.29□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 CAMK2N2Q96S95 79 aa12.29□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 DEFB105AQ8NG35 78 aa12.29□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 CNFNQ9BYD5 112 aa12.29□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 A0A0B4J2C4 111 aa12.28□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 HHLA3Q9XRX5 114 aa12.28□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 MTORP42345 2549 aa12.28□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 F8W735 103 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa12.28□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 CLPSL1A2RUU4 121 aa12.28□□□□□ -0.44
MEGF6-201ENST00000294599 SPART-AS1P0CW21 52 aa12.27□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 RBM3P98179 157 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 RMI2Q96E14 147 aa12.27□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 A0A096LNJ9 63 aa12.26□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 A0A1B0GX51 115 aa12.26□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 CITED1Q99966 193 aa12.26□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 A0A0J9YXY3 114 aa12.26□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa12.26□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 K7EQG2 157 aa12.25□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 IGHV3-30P01768 117 aa12.25□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 IGHV3-33P01772 117 aa12.25□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa12.25□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 DEFB4AO15263 64 aa12.24□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 C9orf66Q5T8R8 295 aa12.24□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 MIAQ16674 131 aa12.24□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 MAP6D1Q9H9H5 199 aa12.24□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa12.24□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa12.23□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 NFE4Q86UQ8 179 aa12.23□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 PCSK5Q92824 1860 aa12.23□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 ATOX1O00244 68 aa12.23□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 DEFB135Q30KP9 77 aa12.23□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 TRIOO75962 3097 aa12.22□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 LRRK2Q5S007 2527 aa12.22□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 C10orf99Q6UWK7 81 aa12.22□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 Q6ZTI0 123 aa12.22□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa12.21□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 UBE2BP63146 152 aa12.21□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 SPAG11BQ08648 103 aa12.21□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 KLK12Q9UKR0 248 aa12.21□□□□□ -0.45
MEGF6-201ENST00000294599 CFAP54Q96N23 3096 aa12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 314.3 ms